More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4488 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4488  ribose-phosphate pyrophosphokinase  100 
 
 
312 aa  626  1e-178  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0737  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.21 
 
 
312 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4394  ribose-phosphate pyrophosphokinase  78.85 
 
 
312 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1467  ribose-phosphate pyrophosphokinase  75.64 
 
 
312 aa  481  1e-135  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000329774  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0016  ribose-phosphate pyrophosphokinase  65.92 
 
 
316 aa  412  1e-114  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.82 
 
 
313 aa  371  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0076  ribose-phosphate pyrophosphokinase  57.93 
 
 
322 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0100  ribose-phosphate pyrophosphokinase  55.81 
 
 
316 aa  363  3e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.100447  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2078  ribose-phosphate pyrophosphokinase  58.31 
 
 
317 aa  362  4e-99  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0069  ribose-phosphate pyrophosphokinase  56.17 
 
 
318 aa  358  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.829297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0661  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.35 
 
 
314 aa  347  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3682  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.02 
 
 
316 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000078681  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0044  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.95 
 
 
315 aa  346  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0587  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.02 
 
 
316 aa  345  4e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000361912  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4733  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.87 
 
 
330 aa  345  4e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0584703 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0206  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
315 aa  346  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.981625  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21230  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.25 
 
 
314 aa  345  4e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000002117  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0048  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4372  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.4 
 
 
338 aa  344  1e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.886643  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0636  ribose-phosphate pyrophosphokinase  54.87 
 
 
325 aa  344  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.532932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0055  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.822435  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0059  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0049  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0056  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5261  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0045  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  344  1e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.993888  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0046  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.95 
 
 
315 aa  343  2e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2677  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
318 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3427  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
318 aa  342  4e-93  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1994  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.75 
 
 
338 aa  341  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1472  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.7 
 
 
316 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0157862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2768  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.38 
 
 
316 aa  339  5e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0630543  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3092  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
319 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2004  phosphoribosyl pyrophosphate synthetase  55.52 
 
 
312 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000613984  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0179  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.73 
 
 
314 aa  336  2.9999999999999997e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2848  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.08 
 
 
314 aa  334  1e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000330674  hitchhiker  0.0000000000848542 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0061  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
322 aa  333  2e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0325861  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0597  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
330 aa  333  2e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4690  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.65 
 
 
330 aa  332  4e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0743  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.4 
 
 
314 aa  332  4e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.549423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3229  ribose-phosphate diphosphokinase  53.57 
 
 
321 aa  332  6e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2113  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
331 aa  332  6e-90  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0740784  normal  0.462424 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2812  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
319 aa  331  8e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0395  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
316 aa  328  9e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00089412  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0589  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.81 
 
 
316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.61 
 
 
319 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0839  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.56 
 
 
317 aa  325  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00175463  normal  0.714962 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4345  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.23 
 
 
323 aa  324  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3498  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.95 
 
 
320 aa  324  1e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000549461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4540  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
359 aa  323  2e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.0000021567  normal  0.35999 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1660  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.88 
 
 
325 aa  323  3e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2595  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.72 
 
 
314 aa  323  3e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00599255  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0277  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
316 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.918759  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0250  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
316 aa  322  4e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1371  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.03 
 
 
331 aa  321  9.999999999999999e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.499997  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0673  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000671501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5433  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.09 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0786  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
332 aa  320  3e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000113332  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1163  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.61 
 
 
315 aa  320  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.285484  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0068  ribose-phosphate diphosphokinase  48.87 
 
 
317 aa  320  3e-86  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0387  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.49 
 
 
316 aa  318  5e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0198132 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0239  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.77 
 
 
311 aa  318  6e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2630  ribose-phosphate pyrophosphokinase  53.55 
 
 
320 aa  318  6e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1760  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
314 aa  318  7e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000290937  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0121  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.58 
 
 
321 aa  318  7e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.917582  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1292  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  318  7.999999999999999e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3730  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.78 
 
 
316 aa  318  9e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.322716 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3463  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  317  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.281933  normal  0.770216 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1610  ribose-phosphate pyrophosphokinase  47.74 
 
 
331 aa  317  2e-85  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0272078 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1293  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.28 
 
 
324 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.891091 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0139  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
321 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0128  ribose-phosphate pyrophosphokinase  52.26 
 
 
321 aa  317  2e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0969  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
329 aa  317  2e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3130  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
324 aa  315  4e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268526  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0342  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  316  4e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.379543  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01246  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
311 aa  316  4e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1524  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
313 aa  315  4e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.152066  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1986  ribose-phosphate pyrophosphokinase  51.29 
 
 
315 aa  316  4e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.675824  normal  0.0111954 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0873  ribose-phosphate pyrophosphokinase  49.68 
 
 
324 aa  315  5e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0289  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50 
 
 
317 aa  315  6e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0125  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
321 aa  315  8e-85  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0779969  normal  0.177896 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2464  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.162098  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2070  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000481775  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2184  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
315 aa  314  9.999999999999999e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0212  phosphoribosylpyrophosphate synthetase  48.88 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00571516 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1920  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.96 
 
 
321 aa  314  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004207  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000977539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3689  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
324 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00564575  normal  0.505374 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0692  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3604  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.8 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00259725  normal  0.154121 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3618  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.294091  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3550  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000537383 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3741  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.32 
 
 
315 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.473037 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.97 
 
 
324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000010971  normal  0.440092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0895  Fis family transcriptional regulator  51.78 
 
 
321 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.944384  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0916  ribose-phosphate pyrophosphokinase  50.48 
 
 
315 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>