More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3564 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_3564  pyrroline-5-carboxylate reductase  100 
 
 
271 aa  542  1e-153  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000486618  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2947  pyrroline-5-carboxylate reductase  61.34 
 
 
272 aa  345  6e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.810347  hitchhiker  0.0042807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0390  pyrroline-5-carboxylate reductase  56.13 
 
 
272 aa  328  7e-89  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.446242 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1154  pyrroline-5-carboxylate reductase  55.76 
 
 
272 aa  311  4.999999999999999e-84  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1437  pyrroline-5-carboxylate reductase  53.18 
 
 
281 aa  296  2e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16375  pyrroline-5-carboxylate reductase  43.07 
 
 
266 aa  229  3e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1616  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
314 aa  218  1e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0170317 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_181  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
267 aa  208  8e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0160  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
267 aa  205  5e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0193  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.13 
 
 
267 aa  205  8e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0548  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.04 
 
 
269 aa  203  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1472  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.31 
 
 
257 aa  194  2e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000561637  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3093  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.96 
 
 
273 aa  192  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0431736  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1084  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.41 
 
 
272 aa  191  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000115496  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1474  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2901  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.89 
 
 
270 aa  189  5.999999999999999e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000081741  unclonable  0.000000152537 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4908  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.52 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0661401  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1378  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
274 aa  188  8e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2480  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.38 
 
 
274 aa  188  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1387  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.85 
 
 
276 aa  188  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2828  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.81 
 
 
270 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.137875  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0218  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.8 
 
 
274 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1570  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.01 
 
 
281 aa  186  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0249  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.69 
 
 
264 aa  185  9e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.236328  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0899  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.11 
 
 
270 aa  183  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000196708 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1412  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.22 
 
 
275 aa  183  3e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00064101  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4718  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.25 
 
 
272 aa  182  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.533737  normal  0.734088 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5047  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.2 
 
 
272 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.518044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4151  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.69 
 
 
273 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1696  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.95 
 
 
272 aa  179  5.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4421  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
271 aa  179  5.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000164624  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5956  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.96 
 
 
267 aa  178  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.377479  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0340  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.89 
 
 
275 aa  177  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0979  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.59 
 
 
270 aa  177  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000628805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1715  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.58 
 
 
271 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000826167  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2920  pyrroline-5-carboxylate reductase  42.16 
 
 
275 aa  176  4e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.495585  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1837  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.63 
 
 
285 aa  175  9e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000989753  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1439  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
262 aa  174  9.999999999999999e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2708  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.44 
 
 
264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.702325  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0476  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.45 
 
 
272 aa  172  5e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0197  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.49 
 
 
271 aa  172  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2850  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1755  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.47 
 
 
270 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.96 
 
 
272 aa  171  9e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0808412  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3031  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.029709  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2783  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2899  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.33 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00203272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2713  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2995  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00170119  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3029  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.71 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0010709  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2791  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.6 
 
 
272 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2732  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.58 
 
 
272 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00058851  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2250  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.95 
 
 
272 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00152908  normal  0.0119667 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2518  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.31 
 
 
271 aa  169  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.554672  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5320  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
272 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0129  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.26 
 
 
280 aa  169  4e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000153189  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5003  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.62 
 
 
264 aa  169  5e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.102233  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0672  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
271 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000211861  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2058  pyrroline-5-carboxylate reductase  39.03 
 
 
264 aa  167  1e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.736428  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0481  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.93 
 
 
267 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790225  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5095  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.364055  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4968  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.96 
 
 
272 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2921  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.85 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3143  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.85 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1615  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.71 
 
 
264 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133748  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0247  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.78 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5145  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
272 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0946  pyrroline-5-carboxylate reductase  40.23 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16300  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.26 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000034622  hitchhiker  0.000154585 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3164  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.55 
 
 
260 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01940  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.33 
 
 
266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2189  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.334092  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0898  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.94 
 
 
270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2215  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.34 
 
 
274 aa  164  2.0000000000000002e-39  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000657284  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03070  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.83 
 
 
272 aa  163  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0995956  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4590  pyrroline-5-carboxylate reductase  40 
 
 
276 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3132  pyrroline-5-carboxylate reductase  32.55 
 
 
260 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3513  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.98 
 
 
267 aa  161  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2541  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.15 
 
 
270 aa  161  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3982  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.97 
 
 
271 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.401857 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0370  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.58 
 
 
272 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0397  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.36 
 
 
270 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0610  pyrroline-5-carboxylate reductase  41.56 
 
 
267 aa  160  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0436215 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1478  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.58 
 
 
280 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1168  pyrroline-5-carboxylate reductase  35.79 
 
 
281 aa  160  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000092936  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3383  pyrroline-5-carboxylate reductase  36.4 
 
 
267 aa  160  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3642  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.17 
 
 
285 aa  159  3e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0716  pyrroline-5-carboxylate reductase  37.87 
 
 
271 aa  160  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.796831  normal  0.766779 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0428  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
269 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0423  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
269 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.244975 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0441  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
269 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0483  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
269 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0422  pyrroline-5-carboxylate reductase  34.09 
 
 
269 aa  159  4e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3055  pyrroline-5-carboxylate reductase  38.06 
 
 
274 aa  158  7e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145614  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1992  hypothetical protein  35.71 
 
 
262 aa  158  9e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0546  pyrroline-5-carboxylate reductase  31.34 
 
 
275 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0533  Pyrroline-5-carboxylate reductase  36.6 
 
 
264 aa  158  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0460  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
269 aa  157  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3222  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
269 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0857  pyrroline-5-carboxylate reductase  33.33 
 
 
269 aa  157  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.236011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>