75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3699 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3699  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 297 aa  617  1e-176  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0882  polysaccharide deacetylase  73.9 
 
 		 308 aa  465  9.999999999999999e-131  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.698941  hitchhiker  0.000000806635 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2979  polysaccharide deacetylase  59.04 
 
 		 302 aa  376  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2557  polysaccharide deacetylase family protein  59.06 
 
 		 311 aa  372  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3232  polysaccharide deacetylase  53.54 
 
 		 301 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0277  polysaccharide deacetylase  46.58 
 
 		 298 aa  279  4e-74  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1416  polysaccharide deacetylase  43.29 
 
 		 301 aa  232  6e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1863  polysaccharide deacetylase  40.14 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6216  polysaccharide deacetylase  40.14 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1887  polysaccharide deacetylase  40.14 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.65071  hitchhiker  0.000000465895 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5164  polysaccharide deacetylase  39.46 
 
 		 298 aa  220  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.372387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2189  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0210397  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1410  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.257761 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1156  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.540807  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2279  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2405  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.498763  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0013  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.478406  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1394  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1884  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  219  5e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.243781  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2241  polysaccharide deacetylase family protein  40.48 
 
 		 298 aa  218  7.999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1773  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.771861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1801  polysaccharide deacetylase  39.8 
 
 		 298 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1318  hypothetical protein  39.8 
 
 		 297 aa  218  1e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0922  polysaccharide deacetylase  39.12 
 
 		 298 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.603398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1254  polysaccharide deacetylase  39.46 
 
 		 297 aa  211  7.999999999999999e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.326584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1193  polysaccharide deacetylase  39.46 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0326614  normal  0.124645 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4593  polysaccharide deacetylase  38.91 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000328095  hitchhiker  0.00511566 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2390  putative polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192005  normal  0.179282 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1797  polysaccharide deacetylase  37.76 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3973  polysaccharide deacetylase  38.44 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0986666  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0923  polysaccharide deacetylase  36.7 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.213028 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2551  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.23 
 
 		 296 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1402  polysaccharide deacetylase  38.23 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3397  polysaccharide deacetylase domain protein  38.23 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1393  polysaccharide deacetylase  38.23 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02141  hypothetical protein  38.23 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2401  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.23 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02182  hypothetical protein  38.23 
 
 		 296 aa  196  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2632  polysaccharide deacetylase domain protein  37.88 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2410  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  38.44 
 
 		 296 aa  195  9e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2844  polysaccharide deacetylase  36.99 
 
 		 294 aa  194  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0804894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1728  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4227  polysaccharide deacetylase  36.52 
 
 		 299 aa  193  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0436  polysaccharide deacetylase  37.21 
 
 		 305 aa  193  2e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.838323 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1834  polysaccharide deacetylase  37.64 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2609  hypothetical protein  37.64 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0430  polysaccharide deacetylase  35.88 
 
 		 305 aa  186  4e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4018  polysaccharide deacetylase  35.49 
 
 		 299 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.745144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2692  polysaccharide deacetylase  35.05 
 
 		 293 aa  185  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145511  normal  0.370687 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2157  polysaccharide deacetylase  36.5 
 
 		 301 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1590  hypothetical protein  36.43 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18340  hypothetical protein  36.08 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1353  polysaccharide deacetylase  34.81 
 
 		 297 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2925  polysaccharide deacetylase  34.13 
 
 		 297 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2485  polysaccharide deacetylase domain protein  37.37 
 
 		 299 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2528  polysaccharide deacetylase domain protein  37.04 
 
 		 299 aa  177  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2436  polysaccharide deacetylase  37.04 
 
 		 299 aa  176  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2540  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.04 
 
 		 299 aa  176  6e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.742561  normal  0.731113 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2644  polysaccharide deacetylase domain-containing protein  37.04 
 
 		 299 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2076  polysaccharide deacetylase  34.01 
 
 		 298 aa  169  6e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4994  polysaccharide deacetylase  23.56 
 
 		 263 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3555  polysaccharide deacetylase  26.15 
 
 		 306 aa  52.8  0.000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34360  predicted xylanase/chitin deacetylase  23.12 
 
 		 296 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0199851  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3101  polysaccharide deacetylase  26.03 
 
 		 299 aa  47  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40589  normal  0.231006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2673  polysaccharide deacetylase  30.84 
 
 		 413 aa  47  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0653115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0203  polysaccharide deacetylase  25.75 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.37611  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6286  polysaccharide deacetylase  24.32 
 
 		 277 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.14057  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3296  polysaccharide deacetylase  22.92 
 
 		 315 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6168  polysaccharide deacetylase  24.73 
 
 		 290 aa  44.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6461  polysaccharide deacetylase  24.59 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.357265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3117  polysaccharide deacetylase  26.52 
 
 		 387 aa  43.5  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0342085  normal  0.78437 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1069  polysaccharide deacetylase  22.63 
 
 		 247 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.364826  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2742  polysaccharide deacetylase  22.62 
 
 		 319 aa  42.7  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3383  polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.130531  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1917  polysaccharide deacetylase  38.6 
 
 		 250 aa  42.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>