30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3522 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_3522  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  255  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1109  hypothetical protein  66.67 
 
 
126 aa  156  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.464875  normal  0.713161 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1960  hypothetical protein  59.65 
 
 
120 aa  153  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2780  hypothetical protein  61.06 
 
 
113 aa  148  3e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1235  hypothetical protein  62.39 
 
 
120 aa  146  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.78083  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6095  hypothetical protein  58.33 
 
 
129 aa  145  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1532  hypothetical protein  60.18 
 
 
113 aa  146  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1020  hypothetical protein  59.48 
 
 
120 aa  144  5e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1049  hypothetical protein  58.56 
 
 
120 aa  141  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4704  hypothetical protein  58.62 
 
 
122 aa  140  8e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1426  hypothetical protein  58.72 
 
 
142 aa  136  8.999999999999999e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.515265  normal  0.103099 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5353  hypothetical protein  51.3 
 
 
122 aa  124  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0462  hypothetical protein  50 
 
 
139 aa  124  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0591  hypothetical protein  44.12 
 
 
129 aa  97.8  4e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4173  hypothetical protein  42.98 
 
 
128 aa  95.9  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00000992156  hitchhiker  0.000000307929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5314  hypothetical protein  44.74 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0514922 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1217  hypothetical protein  37.17 
 
 
124 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.510827  normal  0.279745 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2321  hypothetical protein  39.81 
 
 
111 aa  79.3  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1025  hypothetical protein  31.53 
 
 
114 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1789  hypothetical protein  33.61 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0197071  hitchhiker  0.00126206 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26260  hypothetical protein  30.39 
 
 
118 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.95274  normal  0.0471393 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1701  hypothetical protein  37.04 
 
 
120 aa  55.1  0.0000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3221  hypothetical protein  29.13 
 
 
110 aa  47  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2284  hypothetical protein  24.79 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2338  hypothetical protein  36 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0935  hypothetical protein  31.34 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1973  hypothetical protein  30.88 
 
 
190 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.046319  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3121  hypothetical protein  28.92 
 
 
206 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0870  hypothetical protein  36.36 
 
 
199 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.145449  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3162  hypothetical protein  30 
 
 
205 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>