19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3334 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 595 aa  1181    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  30.34 
 
 		 572 aa  160  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  38.95 
 
 		 442 aa  117  6e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  42.77 
 
 		 683 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  39.13 
 
 		 510 aa  113  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  25.84 
 
 		 611 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  38.38 
 
 		 692 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  38.74 
 
 		 511 aa  100  9e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  40.52 
 
 		 231 aa  95.9  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  35.8 
 
 		 265 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  28.88 
 
 		 698 aa  84  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  32.79 
 
 		 310 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  26.54 
 
 		 659 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  32.71 
 
 		 694 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1741  hypothetical protein  29.82 
 
 		 391 aa  64.7  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  31.02 
 
 		 700 aa  57.4  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  33.33 
 
 		 546 aa  56.6  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  29.69 
 
 		 667 aa  52.8  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  30.65 
 
 		 546 aa  47  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>