18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3662 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  100 
 
 		 659 aa  1282    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  48.53 
 
 		 667 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  39.15 
 
 		 653 aa  248  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  30.27 
 
 		 698 aa  113  9e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  36.06 
 
 		 611 aa  80.5  0.00000000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  25.12 
 
 		 694 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  26.99 
 
 		 700 aa  73.9  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  39.7 
 
 		 706 aa  67.4  0.0000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  26.13 
 
 		 595 aa  66.6  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  36.28 
 
 		 546 aa  65.1  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  25.3 
 
 		 572 aa  55.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3692  putative lipoprotein  33.13 
 
 		 589 aa  51.2  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  35.2 
 
 		 511 aa  49.3  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  28.82 
 
 		 683 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  30.72 
 
 		 692 aa  47.4  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  39.17 
 
 		 525 aa  44.7  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  28.65 
 
 		 442 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1229  pectin acetylesterase  24.88 
 
 		 552 aa  43.9  0.009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>