15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5016 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  100 
 
 		 706 aa  1416    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  39.81 
 
 		 659 aa  94.7  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  38.14 
 
 		 667 aa  88.6  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  28.52 
 
 		 694 aa  84  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  30.72 
 
 		 700 aa  68.2  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  36.97 
 
 		 546 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2712  hypothetical protein  33.69 
 
 		 519 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  32.14 
 
 		 595 aa  63.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  34.2 
 
 		 611 aa  58.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  34.81 
 
 		 653 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  30.99 
 
 		 265 aa  53.5  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  31.63 
 
 		 698 aa  52.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  29.63 
 
 		 442 aa  47.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  32.2 
 
 		 683 aa  46.2  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 310 aa  46.2  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>