13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0230 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0230  hypothetical protein  100 
 
 		 653 aa  1271    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  39.42 
 
 		 659 aa  251  4e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  38.57 
 
 		 667 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  28.12 
 
 		 698 aa  127  5e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  28.19 
 
 		 700 aa  75.5  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  29.38 
 
 		 694 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  28.11 
 
 		 611 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5016  hypothetical protein  35.33 
 
 		 706 aa  57.4  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.276526  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  33.53 
 
 		 511 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  30.88 
 
 		 546 aa  48.9  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  31.35 
 
 		 442 aa  46.6  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  31.49 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0740  pectinesterase  35.59 
 
 		 865 aa  44.3  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>