29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0370 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0370  hypothetical protein  100 
 
 		 525 aa  1054    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  31.62 
 
 		 546 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  47.54 
 
 		 546 aa  71.6  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2794  hypothetical protein  43.86 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6632  hypothetical protein  40.62 
 
 		 243 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0512  hypothetical protein  45.45 
 
 		 239 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3982  hypothetical protein  38.46 
 
 		 230 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.122943 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4446  hypothetical protein  43.01 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1287  hypothetical protein  40.57 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.180976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2038  lipoprotein, putative  41.9 
 
 		 247 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000000251498 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4090  hypothetical protein  39.25 
 
 		 229 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.503896  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3810  hypothetical protein  38.97 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.3727  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4558  hypothetical protein  38.97 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.396699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5746  hypothetical protein  38.97 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0879668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2712  hypothetical protein  36.29 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0134  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1589  hypothetical protein  39.13 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0560718  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0101  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.319012  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0108  putative lipoprotein  39.13 
 
 		 230 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  39.62 
 
 		 659 aa  55.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2089  hypothetical protein  35.56 
 
 		 850 aa  54.3  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  37.12 
 
 		 694 aa  51.2  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  29.49 
 
 		 611 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  26.97 
 
 		 692 aa  49.3  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  31.67 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  31.69 
 
 		 442 aa  49.3  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1103  hypothetical protein  48.31 
 
 		 244 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  32.94 
 
 		 683 aa  45.1  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  28.22 
 
 		 572 aa  44.7  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>