37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2826 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2826  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  100 
 
 		 249 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1486  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  39.6 
 
 		 368 aa  190  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233654  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  39.04 
 
 		 344 aa  179  4e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.494868  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0338  GvpL  29.6 
 
 		 267 aa  139  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3023  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.64 
 
 		 259 aa  115  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.627745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2367  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.64 
 
 		 316 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0341  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.99 
 
 		 360 aa  94.7  1e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2401  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  29.28 
 
 		 279 aa  94  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3028  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.8 
 
 		 250 aa  91.7  9e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1807  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  27.31 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0073  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.69 
 
 		 244 aa  78.6  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.177784  hitchhiker  0.00184802 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1491  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.85 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0699  hypothetical protein  27.86 
 
 		 260 aa  76.6  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1808  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.66 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.580439  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0700  hypothetical protein  27.41 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2834  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  26.36 
 
 		 249 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0703  hypothetical protein  27.32 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1248  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.69 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.140236 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0332  GvpF  23.29 
 
 		 219 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.734625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4701  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.34 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2373  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.1 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1258  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.23 
 
 		 268 aa  56.2  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.811139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6860  hypothetical protein  27.57 
 
 		 273 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.687823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1804  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.62 
 
 		 266 aa  53.9  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.315624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2355  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  28.85 
 
 		 243 aa  52.8  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.76 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2386  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.76 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2380  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.76 
 
 		 263 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461085  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2339  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  19.17 
 
 		 266 aa  49.3  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0186658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3029  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.79 
 
 		 357 aa  46.2  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2409  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  25.65 
 
 		 259 aa  45.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.479683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0055  gas vesicle synthesis GvpLGvpF  24.37 
 
 		 205 aa  45.8  0.0006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00610804  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1809  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  20.72 
 
 		 339 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.835829  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0698  hypothetical protein  21.68 
 
 		 343 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6856  hypothetical protein  24.62 
 
 		 270 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.137065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0213  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  22.3 
 
 		 300 aa  42.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2350  Gas vesicle synthesis GvpLGvpF  23.53 
 
 		 264 aa  42  0.008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.262607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>