More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2655 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2655  pyruvate kinase  100 
 
 
473 aa  972    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1475  pyruvate kinase  66.17 
 
 
481 aa  646    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1852  pyruvate kinase  79.28 
 
 
473 aa  772    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2959  pyruvate kinase  63.64 
 
 
477 aa  605  9.999999999999999e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4085  pyruvate kinase  58.65 
 
 
485 aa  550  1e-155  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.951837  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1642  pyruvate kinase  57.51 
 
 
485 aa  531  1e-149  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.774037  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0175  pyruvate kinase  47.59 
 
 
477 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.281463  normal  0.284093 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1478  pyruvate kinase  49.58 
 
 
475 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1801  pyruvate kinase  49.58 
 
 
474 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0469  pyruvate kinase  45.7 
 
 
477 aa  420  1e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0383  pyruvate kinase  45.07 
 
 
465 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140284  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0582  pyruvate kinase  42.36 
 
 
477 aa  394  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03220  pyruvate kinase  43.79 
 
 
584 aa  382  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000682258  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0527  pyruvate kinase  45.17 
 
 
499 aa  385  1e-105  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1867  pyruvate kinase  43.76 
 
 
477 aa  379  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2040  pyruvate kinase  41.31 
 
 
582 aa  370  1e-101  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2755  pyruvate kinase  42.28 
 
 
577 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000113903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1056  pyruvate kinase  44.33 
 
 
585 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00524039  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0815  pyruvate kinase  40.88 
 
 
583 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417655 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2312  pyruvate kinase  44.37 
 
 
583 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1195  pyruvate kinase., pyruvate, water dikinase  41.95 
 
 
583 aa  367  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000647409  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0381  pyruvate kinase  43.25 
 
 
578 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1867  pyruvate kinase  42.8 
 
 
582 aa  353  4e-96  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1179  pyruvate kinase  43.63 
 
 
476 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1428  pyruvate kinase  41.39 
 
 
478 aa  345  1e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.262848  hitchhiker  0.00576902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2685  pyruvate kinase  40.38 
 
 
588 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000142008  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2602  pyruvate kinase  42.92 
 
 
471 aa  341  2e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.272565  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1040  pyruvate kinase  41.54 
 
 
480 aa  341  2e-92  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2352  pyruvate kinase  40.93 
 
 
472 aa  340  2e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.401076  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0677  pyruvate kinase  40.25 
 
 
590 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1692  pyruvate kinase  41.8 
 
 
479 aa  339  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309469  unclonable  0.00000000134054 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0778  pyruvate kinase  40.93 
 
 
587 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3282  pyruvate kinase  40.13 
 
 
585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.829257  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1917  pyruvate kinase  41.3 
 
 
478 aa  336  7e-91  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4669  pyruvate kinase  44.71 
 
 
509 aa  335  9e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.725037  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1266  pyruvate kinase  39.3 
 
 
585 aa  335  9e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000010731  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0550  pyruvate kinase  39.37 
 
 
580 aa  335  1e-90  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0357286  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1788  pyruvate kinase  39.37 
 
 
585 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1754  pyruvate kinase  39.37 
 
 
585 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.723076  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1461  pyruvate kinase  40.98 
 
 
474 aa  334  2e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.566125  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1980  pyruvate kinase  41.49 
 
 
478 aa  333  3e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.237893  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2535  pyruvate kinase  40.47 
 
 
471 aa  333  5e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0129939  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0005  pyruvate kinase  41.18 
 
 
482 aa  333  5e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0168768  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3162  pyruvate kinase  39.87 
 
 
477 aa  333  5e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0597738  normal  0.419031 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2862  pyruvate kinase  41.49 
 
 
476 aa  332  6e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0222457  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2953  Pyruvate kinase  40 
 
 
476 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3385  pyruvate kinase  40.51 
 
 
482 aa  332  7.000000000000001e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.468525  normal  0.558043 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3591  pyruvate kinase  39.09 
 
 
472 aa  332  8e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.802913  normal  0.0255261 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1261  pyruvate kinase  39.16 
 
 
585 aa  332  9e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0312  pyruvate kinase  42.58 
 
 
474 aa  332  1e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.838542  normal  0.668363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4383  pyruvate kinase  43.76 
 
 
491 aa  332  1e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.116424 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2354  pyruvate kinase  39.83 
 
 
476 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0122  pyruvate kinase  40.04 
 
 
480 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000177516  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0037  pyruvate kinase  40.87 
 
 
470 aa  330  5.0000000000000004e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0413  pyruvate kinase  44.17 
 
 
479 aa  329  8e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2824  pyruvate kinase  38.59 
 
 
472 aa  328  9e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0741  pyruvate kinase  38.2 
 
 
580 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09951  pyruvate kinase  40.09 
 
 
596 aa  328  1.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2744  pyruvate kinase  40.17 
 
 
491 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000110572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4729  pyruvate kinase  39.41 
 
 
585 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4492  pyruvate kinase  39.62 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0550646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4327  pyruvate kinase  39.62 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4339  pyruvate kinase  39.62 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.113971  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4724  pyruvate kinase  39.41 
 
 
585 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4843  pyruvate kinase  39.62 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3042  pyruvate kinase  38.38 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.139243  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4713  pyruvate kinase  39.62 
 
 
585 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0392602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3101  pyruvate kinase  38.38 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509766  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3058  pyruvate kinase  38.38 
 
 
472 aa  327  2.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.947696  normal  0.788477 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4708  pyruvate kinase  39.41 
 
 
585 aa  327  3e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1702  pyruvate kinase  40.82 
 
 
470 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000472586  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0922  pyruvate kinase  38.28 
 
 
470 aa  327  3e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000158299  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2441  pyruvate kinase  40.43 
 
 
470 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000184236  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09471  pyruvate kinase  38.49 
 
 
596 aa  326  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4428  pyruvate kinase  39.29 
 
 
585 aa  326  5e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2701  pyruvate kinase  40.65 
 
 
470 aa  326  6e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1766  pyruvate kinase  41.75 
 
 
472 aa  325  8.000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.179073 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0004  pyruvate kinase  41.74 
 
 
474 aa  325  8.000000000000001e-88  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00236484  normal  0.256492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3160  pyruvate kinase  40.3 
 
 
482 aa  325  9e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0251321 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0004  pyruvate kinase  41.76 
 
 
474 aa  325  1e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.328541  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08471  pyruvate kinase  40.59 
 
 
580 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.892496  hitchhiker  0.00279179 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0888  pyruvate kinase  38.96 
 
 
597 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.918446  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09491  pyruvate kinase  38.28 
 
 
596 aa  325  1e-87  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0529  pyruvate kinase  39.67 
 
 
585 aa  324  2e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2569  pyruvate kinase  36.31 
 
 
580 aa  324  2e-87  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0396442  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3070  pyruvate kinase  41.24 
 
 
472 aa  324  2e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000899763  hitchhiker  0.00558917 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09671  pyruvate kinase  38.53 
 
 
485 aa  324  2e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.290889  normal  0.0962448 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0295  pyruvate kinase  38.53 
 
 
485 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1063  pyruvate kinase  39.11 
 
 
483 aa  323  6e-87  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3440  pyruvate kinase  39.83 
 
 
601 aa  322  7e-87  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.386221 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2900  pyruvate kinase  40.34 
 
 
474 aa  322  8e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000957395  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3804  pyruvate kinase  39.5 
 
 
476 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00347272 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2582  pyruvate kinase  42.4 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3524  pyruvate kinase  42.4 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1693  pyruvate kinase  40.17 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.119526  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2215  pyruvate kinase  39.41 
 
 
474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1209  hypothetical protein  45.78 
 
 
481 aa  320  5e-86  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000430892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1892  pyruvate kinase  40.7 
 
 
470 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000024147  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01635  hypothetical protein  40.7 
 
 
470 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000427708  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1520  pyruvate kinase  40.7 
 
 
470 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000224591  decreased coverage  0.00000000336273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>