More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0649 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3297  iron-sulfur cluster-binding protein  79.57 
 
 
421 aa  721    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0649  hypothetical protein  100 
 
 
421 aa  859    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3246  hypothetical protein  80.71 
 
 
421 aa  711    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000932954 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0563  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  77.2 
 
 
426 aa  697    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0576  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  76.96 
 
 
426 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000399762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0525  hypothetical protein  75.3 
 
 
428 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000837043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3264  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  70.57 
 
 
428 aa  629  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.726047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2766  Fe-S oxidoreductase  44.58 
 
 
423 aa  375  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000181716  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4517  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35 
 
 
434 aa  293  5e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2307  hypothetical protein  37.26 
 
 
423 aa  290  3e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2541  hypothetical protein  35.51 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000879151  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1037  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.44 
 
 
432 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.106795  normal  0.550231 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3240  iron-sulfur cluster-binding protein  36.73 
 
 
430 aa  281  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.730489  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1993  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.1 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0345  hypothetical protein  35.87 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.268241  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1047  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.46 
 
 
429 aa  267  2e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1863  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  35.31 
 
 
430 aa  267  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1372  hypothetical protein  35.14 
 
 
423 aa  266  7e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000298572  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0393  hypothetical protein  38.14 
 
 
437 aa  262  1e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.544976  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0561  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  34.21 
 
 
423 aa  259  6e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1222  hypothetical protein  33.81 
 
 
432 aa  256  8e-67  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000332946  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0987  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  36.94 
 
 
411 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.965573  hitchhiker  0.00212312 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0706  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.59 
 
 
414 aa  232  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0433  CoB--CoM heterodisulfide reductase  33.01 
 
 
722 aa  229  7e-59  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.184544  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0039  hypothetical protein  33.18 
 
 
431 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000157521 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1012  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  32.32 
 
 
430 aa  223  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.443233  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1132  conserved hypothetical protein, putative iron-sulfur-cluster binding protein  30.79 
 
 
422 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1314  protein of unknown function DUF162  33.73 
 
 
711 aa  219  7e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000036921 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1071  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  30.6 
 
 
421 aa  219  1e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4384  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.88 
 
 
414 aa  218  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000797967  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1009  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  30.36 
 
 
421 aa  218  2e-55  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0385  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.64 
 
 
420 aa  216  4e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0798  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  30.6 
 
 
421 aa  216  5e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.417746  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2911  protein of unknown function DUF162  32.61 
 
 
711 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0843  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  32.46 
 
 
418 aa  212  1e-53  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000303103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0152  hypothetical protein  32.86 
 
 
711 aa  211  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0230619  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3135  hypothetical protein  32.7 
 
 
712 aa  210  5e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0497741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2305  hypothetical protein  32.1 
 
 
730 aa  209  6e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1568  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  30.48 
 
 
420 aa  205  1e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000718376  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0607  hypothetical protein  29.88 
 
 
427 aa  204  3e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.682532  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1616  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  29.59 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3083  protein of unknown function DUF162  31.65 
 
 
717 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000122651  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2198  hypothetical protein  32.13 
 
 
413 aa  196  6e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000446379  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0568  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.57 
 
 
433 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1624  glycolate oxidase iron-sulfur subunit, putative  30.83 
 
 
416 aa  194  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957956  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0340  hypothetical protein  30.14 
 
 
717 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.491762  normal  0.765012 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1409  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit, putative  29.45 
 
 
442 aa  193  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3997  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  29.45 
 
 
442 aa  193  6e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.437745 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1189  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  29.22 
 
 
442 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2533  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.04 
 
 
442 aa  192  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1449  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  29.22 
 
 
442 aa  191  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1211  hypothetical protein  29.22 
 
 
442 aa  191  2e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1209  glycolate oxidase iron-sulfur subunit  28.98 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1308  glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.98 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1347  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.98 
 
 
442 aa  190  5e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1187  (S)-2-hydroxy-acid oxidase  28.98 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1991  protein of unknown function DUF162  30.93 
 
 
716 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1385  putative glycolate oxidase, iron-sulfur subunit  28.98 
 
 
442 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0690  hypothetical protein  30.92 
 
 
714 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2905  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.81 
 
 
413 aa  186  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.201803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1620  iron-sulfur cluster binding protein, putative  29.69 
 
 
708 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3245  iron-sulfur cluster-binding protein  32.21 
 
 
713 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0188775  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1320  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  30.05 
 
 
413 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5522600000000002e-26 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1017  hypothetical protein  29.45 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1167  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.3 
 
 
404 aa  182  7e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3607  hypothetical protein  31.12 
 
 
445 aa  177  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4296  hypothetical protein  31.12 
 
 
441 aa  176  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1528  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  31.72 
 
 
465 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.389896  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1031  protein of unknown function DUF162  28.02 
 
 
717 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0202233  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4801  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.44 
 
 
543 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.18268  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0162  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.47 
 
 
447 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2756  hypothetical protein  31.64 
 
 
425 aa  169  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4555  hypothetical protein  27.55 
 
 
450 aa  167  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1868  protein of unknown function DUF162  28.9 
 
 
716 aa  167  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1136  hypothetical protein  30.23 
 
 
416 aa  167  4e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.409696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2368  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.98 
 
 
453 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0824  hypothetical protein  28.81 
 
 
435 aa  164  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000698259 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1717  glycolate oxidase subunit (Fe-S) protein  27.75 
 
 
433 aa  163  4.0000000000000004e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1915  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.18 
 
 
452 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000454942  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2951  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.36 
 
 
438 aa  163  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00704386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3389  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.2 
 
 
445 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.67964  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0623  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  30.36 
 
 
425 aa  159  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1729  protein of unknown function DUF162  29.74 
 
 
712 aa  158  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5350  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.2 
 
 
453 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0320  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.3 
 
 
494 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.031272 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2256  protein of unknown function DUF162  27.17 
 
 
767 aa  158  2e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000000158241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4473  hypothetical protein  29.93 
 
 
435 aa  158  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000823038 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02300  Fe-S oxidoreductase  28.47 
 
 
428 aa  157  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0819233  normal  0.515319 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0522  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  30.3 
 
 
494 aa  157  4e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.437675  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1427  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  29.61 
 
 
420 aa  157  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1953  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.13 
 
 
447 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1592  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  29.8 
 
 
494 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.220062  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1980  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  26.13 
 
 
447 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.763883  normal  0.0943546 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1611  hypothetical protein  36.51 
 
 
241 aa  153  4e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0746419  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0390  hypothetical protein  28.19 
 
 
721 aa  154  4e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2056  protein of unknown function DUF224, cysteine-rich region  26.32 
 
 
471 aa  153  5e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0566  protein of unknown function DUF162  30.42 
 
 
710 aa  153  7e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0390  succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulfur subunit  28.89 
 
 
494 aa  152  1e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.573606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3045  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  28.88 
 
 
438 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00467666  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1607  protein of unknown function DUF224 cysteine-rich region domain protein  37.34 
 
 
241 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.096074  normal  0.366344 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>