19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0621 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0621  hypothetical protein  100 
 
 		 572 aa  1143    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0112411  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3418  hypothetical protein  34.94 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00172451  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3334  hypothetical protein  30.76 
 
 		 595 aa  154  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000666243  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2329  cytochrome c family protein  38.55 
 
 		 442 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1881  cytochrome c family protein  36.67 
 
 		 510 aa  92.8  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1761  cytochrome c family protein  36.18 
 
 		 511 aa  91.7  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0745977  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  36.46 
 
 		 683 aa  90.1  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1851  hypothetical protein  35.43 
 
 		 265 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  34.01 
 
 		 692 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0504  cell wall surface anchor family protein, putative  32.95 
 
 		 667 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2143  cytochrome c family protein  30.18 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000152859  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1860  hypothetical protein  33 
 
 		 546 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0085  hypothetical protein  35.11 
 
 		 546 aa  60.5  0.00000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3662  cell wall surface anchor family protein, putative  26.08 
 
 		 659 aa  60.1  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1402  hypothetical protein  25.98 
 
 		 698 aa  60.1  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.863964  normal  0.205205 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0528  hypothetical protein  27.23 
 
 		 606 aa  59.3  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0627546  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3844  hypothetical protein  35.1 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5050  hypothetical protein  35.06 
 
 		 700 aa  51.6  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.567325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1742  hypothetical protein  22 
 
 		 231 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0658117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>