42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0555 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0555  YcfA family protein  100 
 
 		 80 aa  162  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2121  hypothetical protein  41.67 
 
 		 80 aa  72.4  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0116167  normal  0.982172 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0621  YcfA-like protein  45.33 
 
 		 76 aa  70.1  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2669  YcfA family protein  47.22 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.16159 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2649  YcfA-like  45.59 
 
 		 81 aa  67.8  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3514  YcfA family protein  38.89 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2603  YcfA family protein  38.89 
 
 		 76 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0484  YcfA-like  40.28 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0494568  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0980  YcfA family protein  38.57 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000157599  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1494  hypothetical protein  41.67 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0656607  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4579  YcfA-like  40 
 
 		 78 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3102  YcfA-like  44.29 
 
 		 129 aa  55.8  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0480568  normal  0.0893777 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1471  YcfA family protein  38.89 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1100  YcfA family protein  40 
 
 		 73 aa  53.9  0.0000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.417133 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0298  YcfA-like  36.62 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.09568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0175  YcfA family protein  37.5 
 
 		 73 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1512  YcfA family protein  39.68 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0170  YcfA family protein  37.5 
 
 		 73 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.58816  normal  0.310451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0848  YcfA family protein  34.29 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.230589 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0711  YcfA-like  32.88 
 
 		 77 aa  50.8  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1788  hypothetical protein  34.29 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.027343 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1230  YcfA family protein  41.43 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4632  YcfA family protein  35.9 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4469  YcfA family protein  35.9 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3185  YcfA family protein  34.25 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.232391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0250  YcfA-like  38.89 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2779  YcfA-like  33.33 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2005  YcfA family protein  36.11 
 
 		 74 aa  47.4  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0386325  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0870  hypothetical protein  36.84 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000000055222  normal  0.0369438 
 
 
 
NC_013161  Cyan8802_1678  YcfA family protein  36.92 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.830575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0377  YcfA-like  32.88 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0773151 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1322  YcfA-like  37.66 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4650  YcfA family protein  31.58 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113321 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5959  YcfA family protein  39.44 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.489915  normal  0.253487 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1660  YcfA family protein  35.38 
 
 		 64 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0022  hypothetical protein  30.88 
 
 		 67 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.304124  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1240  YcfA family protein  36.84 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1441  YcfA family protein  32.86 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0355  hypothetical protein  35.71 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1350  YcfA family protein  30.26 
 
 		 75 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2932  YcfA family protein  28.81 
 
 		 60 aa  40.4  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5956  YcfA family protein  32.39 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.246481 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>