30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4994 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4994  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  806    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0190  ATPase  74.18 
 
 		 393 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0143  ATPase  72.75 
 
 		 397 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4542  hypothetical protein  72.99 
 
 		 412 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.930892 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5052  hypothetical protein  72.51 
 
 		 412 aa  558  1e-158  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635764 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01160  hypothetical protein  67.61 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0115  ATPase  73.42 
 
 		 391 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0159  hypothetical protein  69.17 
 
 		 400 aa  520  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0645  hypothetical protein  40.36 
 
 		 396 aa  269  5e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0718  hypothetical protein  40.55 
 
 		 397 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000890529 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0031  ATPase  37.97 
 
 		 396 aa  250  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.42307  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0111  hypothetical protein  40.66 
 
 		 395 aa  246  4.9999999999999997e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.0000000108585  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0571  ATPase  33.33 
 
 		 461 aa  179  1e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.195341  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2291  hypothetical protein  31.71 
 
 		 449 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4863  hypothetical protein  42.13 
 
 		 204 aa  146  7.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.160787 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1552  hypothetical protein  38.46 
 
 		 199 aa  114  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06140  hypothetical protein  27.1 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4293  hypothetical protein  30.71 
 
 		 457 aa  100  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1456  hypothetical protein  26.62 
 
 		 368 aa  89.7  7e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13070  hypothetical protein  26.92 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.20645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20400  hypothetical protein  26.18 
 
 		 393 aa  81.6  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02770  ATPase  24.94 
 
 		 364 aa  79.3  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25650  hypothetical protein  27.8 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05970  hypothetical protein  26.04 
 
 		 416 aa  57  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.215933 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0503  hypothetical protein  22.31 
 
 		 362 aa  54.7  0.000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0128  ATPase family protein  23.56 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000122266 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4896  hypothetical protein  23.45 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.815839 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2984  PAS sensor protein  32.57 
 
 		 2109 aa  44.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.591507  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0542  ATPase  19.84 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2475  secretion ATPase, PEP-CTERM locus subfamily  27.57 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>