43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3531 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3531  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0665309  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3449  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.394614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2917  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 269 aa  536  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.381355  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2974  transposase IS4 family protein  77.7 
 
 		 284 aa  417  9.999999999999999e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0696  transposase IS4 family protein  68.28 
 
 		 269 aa  297  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2996  transposase IS4 family protein  46.13 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1122  transposase  45.39 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2530  transposase  45.39 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2546  transposase  45.39 
 
 		 277 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6762  transposase IS4 family protein  46.13 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2771  transposase IS4 family protein  46.13 
 
 		 277 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5748  transposase IS4 family protein  45.76 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.970516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2963  transposase IS4 family protein  45.02 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3548  transposase IS4 family protein  48.54 
 
 		 292 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0747945  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0248  transposase  50.78 
 
 		 211 aa  176  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0960  hypothetical protein  47.06 
 
 		 282 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.55535  normal  0.524457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0583  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.319362  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3271  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.524665  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1998  transposase IS4 family protein  42.26 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0111459 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0183  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3659  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6087  transposase IS4 family protein  38.81 
 
 		 280 aa  154  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3646  transposase, IS4 family  39.19 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3041  transposase IS4 family protein  37.87 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3105  transposase IS4 family protein  37.87 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.297989  normal  0.0228656 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0143  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1783  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.138367 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2062  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2531  response regulator receiver protein  37.31 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3416  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  35.19 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4217  transposase, IS4  46.71 
 
 		 188 aa  127  3e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.829185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0585  transposase IS4 family protein  41.89 
 
 		 253 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.384554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0120  response regulator receiver protein  36.11 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0961  transposase, IS4  37.01 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0578745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4558  transposase IS4 family protein  37.89 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.16009  normal  0.0149064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0963  hypothetical protein  36.5 
 
 		 326 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4215  hypothetical protein  49.43 
 
 		 122 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1206  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2602  transposase IS4 family protein  27.92 
 
 		 309 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.159283  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3429  transposase IS4 family protein  36.13 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3432  transposase IS4 family protein  34.03 
 
 		 262 aa  42.7  0.006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4578  transposase IS4 family protein  28.87 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3115  transposase IS4 family protein  27.63 
 
 		 162 aa  42.4  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989932  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>