More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2763 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2763  oxidoreductase domain protein  100 
 
 		 395 aa  799    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.403107  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0117  oxidoreductase domain protein  49.62 
 
 		 398 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4617  oxidoreductase domain protein  52.96 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1811  oxidoreductase domain-containing protein  49.1 
 
 		 392 aa  335  9e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.483948 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4779  oxidoreductase domain protein  36.86 
 
 		 388 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.976616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0988  oxidoreductase domain-containing protein  36.15 
 
 		 390 aa  227  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1911  oxidoreductase domain-containing protein  39.18 
 
 		 390 aa  224  3e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1725  oxidoreductase-like protein  37.06 
 
 		 387 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3328  oxidoreductase domain-containing protein  37.17 
 
 		 359 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.686493  normal  0.496755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1340  oxidoreductase domain protein  35.68 
 
 		 377 aa  212  7.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01590  predicted dehydrogenase  35.97 
 
 		 419 aa  212  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2997  oxidoreductase domain protein  35.42 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2827  oxidoreductase domain-containing protein  35.86 
 
 		 373 aa  207  3e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1357  oxidoreductase domain protein  36.98 
 
 		 393 aa  204  2e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3335  oxidoreductase domain protein  34.46 
 
 		 377 aa  204  3e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1442  oxidoreductase domain-containing protein  34.11 
 
 		 376 aa  202  7e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4094  oxidoreductase domain protein  36.09 
 
 		 378 aa  199  6e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3564  oxidoreductase domain-containing protein  34.9 
 
 		 376 aa  199  7e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0520703 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1729  oxidoreductase-like protein  36.67 
 
 		 396 aa  199  7.999999999999999e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0833766  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4032  oxidoreductase domain protein  31.78 
 
 		 385 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0540753 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0390  oxidoreductase domain protein  37.03 
 
 		 397 aa  197  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  decreased coverage  0.00594685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1354  oxidoreductase domain protein  35.62 
 
 		 398 aa  197  3e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.189914  normal  0.772434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11070  predicted dehydrogenase  35.64 
 
 		 386 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.555168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15590  predicted dehydrogenase  35.86 
 
 		 379 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.729265  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2614  oxidoreductase domain-containing protein  35.75 
 
 		 387 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1830  oxidoreductase domain-containing protein  33.85 
 
 		 376 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0800695  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0087  oxidoreductase domain-containing protein  34.68 
 
 		 397 aa  195  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2881  oxidoreductase domain-containing protein  36.64 
 
 		 388 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2408  oxidoreductase domain protein  35.99 
 
 		 380 aa  194  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2970  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  35.84 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3042  oxidoreductase domain-containing protein  35.84 
 
 		 377 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1871  hypothetical protein  35.84 
 
 		 377 aa  193  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00529235 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2299  oxidoreductase domain protein  35.26 
 
 		 378 aa  193  6e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000000176131  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1680  oxidoreductase domain-containing protein  40.83 
 
 		 372 aa  192  9e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.507228 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1583  dehydrogenase  32.12 
 
 		 378 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000299864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2880  oxidoreductase domain-containing protein  35.49 
 
 		 387 aa  189  9e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4326  oxidoreductase domain protein  38.52 
 
 		 413 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1593  oxidoreductase domain-containing protein  30.29 
 
 		 388 aa  188  1e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50290  oxidoreductase  33.25 
 
 		 369 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.569794  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1343  oxidoreductase, putative  33.25 
 
 		 371 aa  187  4e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3848  oxidoreductase domain protein  35.51 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1303  putative oxidoreductase  32.99 
 
 		 371 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5196  oxidoreductase domain protein  36.43 
 
 		 388 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0156  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 396 aa  182  7e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1384  oxidoreductase domain protein  31.41 
 
 		 389 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.000847261  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8256  hypothetical protein  34.63 
 
 		 409 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0185065 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2330  oxidoreductase domain-containing protein  33.33 
 
 		 373 aa  181  2e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0250  oxidoreductase domain protein  34.35 
 
 		 403 aa  180  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1137  oxidoreductase domain protein  31.32 
 
 		 371 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.985714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0141  oxidoreductase domain protein  32.38 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0984  oxidoreductase domain protein  31.58 
 
 		 371 aa  178  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.915722 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2455  oxidoreductase, N-terminal:oxidoreductase, C-terminal  34.19 
 
 		 382 aa  177  3e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.834174  hitchhiker  0.00910269 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2153  oxidoreductase domain protein  35.37 
 
 		 387 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.491696  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1497  oxidoreductase domain-containing protein  31.7 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000119616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2773  oxidoreductase domain protein  33.33 
 
 		 391 aa  176  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1270  oxidoreductase domain protein  33.42 
 
 		 372 aa  176  9e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.722291 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0572  oxidoreductase domain-containing protein  34.84 
 
 		 398 aa  175  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1488  oxidoreductase domain protein  30.37 
 
 		 389 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.927102 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3682  oxidoreductase domain-containing protein  33.77 
 
 		 418 aa  172  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.595723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3604  oxidoreductase domain protein  35.84 
 
 		 409 aa  172  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.289297  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3167  oxidoreductase domain protein  30.85 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2398  oxidoreductase domain protein  34.86 
 
 		 398 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10530  predicted dehydrogenase  34.42 
 
 		 396 aa  170  5e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1421  oxidoreductase-like  32.3 
 
 		 367 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2489  oxidoreductase domain protein  31.01 
 
 		 393 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.784831  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0068  oxidoreductase domain protein  34.29 
 
 		 409 aa  169  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0993  oxidoreductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 385 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1190  oxidoreductase domain protein  35.52 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.103704  normal  0.518496 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2722  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  34.73 
 
 		 382 aa  162  7e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.327917  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4379  oxidoreductase domain protein  32.03 
 
 		 369 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.441684  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3347  oxidoreductase-like  32.49 
 
 		 367 aa  157  4e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0144127  normal  0.198218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1619  oxidoreductase domain protein  32.49 
 
 		 377 aa  156  6e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.699315 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4458  oxidoreductase domain protein  32.05 
 
 		 386 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0970  oxidoreductase domain protein  28.79 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.688138  normal  0.0152041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3430  oxidoreductase  31.25 
 
 		 359 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.860811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1047  oxidoreductase domain protein  31.54 
 
 		 374 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2400  oxidoreductase domain protein  31.2 
 
 		 378 aa  145  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2258  oxidoreductase domain protein  30.93 
 
 		 371 aa  144  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0680457  normal  0.675266 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2963  oxidoreductase domain protein  28.13 
 
 		 384 aa  142  8e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2949  oxidoreductase domain protein  28.35 
 
 		 384 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1088  oxidoreductase domain protein  28.72 
 
 		 382 aa  136  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5057  oxidoreductase domain protein  27.68 
 
 		 381 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1084  oxidoreductase domain-containing protein  28.64 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.413196 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1461  oxidoreductase-like  29.79 
 
 		 386 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.885347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3060  oxidoreductase domain protein  28.17 
 
 		 383 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0581  oxidoreductase domain-containing protein  31.4 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.219472  normal  0.668755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1274  oxidoreductase domain protein  28.5 
 
 		 383 aa  126  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2791  oxidoreductase domain-containing protein  30.82 
 
 		 382 aa  126  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3435  oxidoreductase domain protein  25.89 
 
 		 381 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31670  predicted dehydrogenase  29.69 
 
 		 353 aa  123  6e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1913  oxidoreductase domain-containing protein  31.15 
 
 		 384 aa  120  3e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1194  oxidoreductase domain protein  28.03 
 
 		 384 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.203815  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1062  oxidoreductase domain-containing protein  27.46 
 
 		 380 aa  117  3e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4657  oxidoreductase domain-containing protein  28.61 
 
 		 366 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.199713  hitchhiker  0.00440873 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3271  oxidoreductase, Gfo/Idh/MocA family  27.85 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1489  oxidoreductase domain protein  25.58 
 
 		 377 aa  114  4.0000000000000004e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.414033  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0199  oxidoreductase domain-containing protein  23.91 
 
 		 374 aa  113  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4042  oxidoreductase domain-containing protein  29.7 
 
 		 366 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.322448 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3045  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.52 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3280  Gfo/Idh/MocA family oxidoreductase  27.52 
 
 		 349 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>