38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2561 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2561  CsbD family protein  100 
 
 		 56 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1078  CsbD family protein  62.5 
 
 		 56 aa  72.8  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.138079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3456  CsbD family protein  51.79 
 
 		 56 aa  60.8  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0288514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3578  CsbD family protein  53.57 
 
 		 57 aa  60.5  0.000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4993  CsbD family protein  51.79 
 
 		 57 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0195  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  58.5  0.00000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3574  CsbD family protein  51.79 
 
 		 58 aa  57.4  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3758  CsbD family protein  50 
 
 		 64 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.398695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3380  CsbD family protein  52.38 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.579569 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4913  CsbD family protein  50.91 
 
 		 63 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.39688  normal  0.521476 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3804  CsbD-like  48.21 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.41973  normal  0.44749 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4790  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.354066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5089  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.634424 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4704  CsbD-like protein  46.43 
 
 		 57 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0307  CsbD family protein  51.79 
 
 		 60 aa  54.7  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02330  CsbD-like stress response protein  52.73 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2052  CsbD family protein  48.21 
 
 		 61 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5110  CsbD family protein  50 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0220  hypothetical protein  41.07 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3066  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  52.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0200  CsbD family protein  41.07 
 
 		 64 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37400  CsbD-like protein  44.64 
 
 		 57 aa  51.6  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0215657  normal  0.523967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1217  CsbD family protein  44.64 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4568  CsbD family protein  50 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3681  CsbD family protein  42.86 
 
 		 76 aa  50.4  0.000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340646  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2222  CsbD family protein  48.98 
 
 		 63 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0127575 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3271  CsbD family protein  48.21 
 
 		 58 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11610  CsbD-like protein  39.29 
 
 		 58 aa  48.9  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.583154 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4239  CsbD family protein  46.43 
 
 		 57 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.541601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5162  CsbD family protein  48.21 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0616  CsbD family protein  43.64 
 
 		 63 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.396611  normal  0.591688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1596  hypothetical protein  41.82 
 
 		 63 aa  42.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0312  CsbD family protein  47.83 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3231  CsbD family protein  42.86 
 
 		 67 aa  42  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.533713  normal  0.0212148 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0658  CsbD family protein  41.82 
 
 		 63 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3114  CsbD family protein  47.27 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0661187 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3345  CsbD family protein  42.59 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.97311  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3782  CsbD-like  41.82 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.45663  normal  0.0243288 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>