126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2063 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 280 aa  542  1e-153  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  62.67 
 
 		 244 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  58.04 
 
 		 273 aa  229  3e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  65.4 
 
 		 251 aa  229  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  60.94 
 
 		 248 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  60.17 
 
 		 280 aa  224  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  52.04 
 
 		 270 aa  219  5e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  56.16 
 
 		 254 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  60.19 
 
 		 238 aa  213  3.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  48.45 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  53.54 
 
 		 269 aa  206  5e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  55.29 
 
 		 240 aa  205  8e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  52 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  53.39 
 
 		 253 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  57 
 
 		 258 aa  202  7e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  58.11 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  54.27 
 
 		 291 aa  182  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  58.45 
 
 		 308 aa  181  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  48.64 
 
 		 220 aa  175  7e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  45.5 
 
 		 271 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  48.85 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  47.11 
 
 		 245 aa  169  5e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  47.62 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 238 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  47.14 
 
 		 238 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  46.89 
 
 		 268 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  45.93 
 
 		 238 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  50.44 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  46.85 
 
 		 275 aa  159  6e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  43.38 
 
 		 289 aa  155  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  46.45 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  41.59 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  41.74 
 
 		 248 aa  143  3e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 		 245 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1670  putative transcriptional regulator  47.53 
 
 		 270 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  38.68 
 
 		 212 aa  119  4.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  37.93 
 
 		 209 aa  113  4.0000000000000004e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  37.44 
 
 		 211 aa  111  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  37.56 
 
 		 219 aa  110  3e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  33.97 
 
 		 211 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3788  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  96.3  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4136  hypothetical protein  33.33 
 
 		 214 aa  95.9  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  27.88 
 
 		 210 aa  95.9  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  95.9  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 210 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  27.4 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  27.4 
 
 		 210 aa  94.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  26.92 
 
 		 210 aa  90.5  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  26.44 
 
 		 210 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 219 aa  89.4  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  33.52 
 
 		 215 aa  89  8e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  28.85 
 
 		 219 aa  89  9e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  26.96 
 
 		 210 aa  88.2  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  31.52 
 
 		 207 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 235 aa  85.9  8e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  27.49 
 
 		 217 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  31.13 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 228 aa  84.3  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  30.57 
 
 		 253 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  30.22 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0077  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 246 aa  82.4  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.53122  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  30.81 
 
 		 207 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  30.33 
 
 		 208 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  30.43 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  29.73 
 
 		 207 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1043  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1494  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  31.88 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  28.42 
 
 		 205 aa  80.5  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  30.05 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  29.12 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  32.02 
 
 		 207 aa  79.7  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  30.56 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5538  putative transcriptional regulator  28.72 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.912326  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  26.11 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  27.45 
 
 		 220 aa  75.9  0.0000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1048  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 207 aa  75.5  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  27.54 
 
 		 215 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  32.95 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  26.6 
 
 		 206 aa  71.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  26.7 
 
 		 206 aa  72  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  29.72 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  28.85 
 
 		 205 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  30.65 
 
 		 209 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4139  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.936463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  28.43 
 
 		 210 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  30.09 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  28.89 
 
 		 234 aa  69.3  0.00000000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>