118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2732 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2732  putative transcriptional regulator  100 
 
 
220 aa  437  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0409175 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3678  putative transcriptional regulator  83.57 
 
 
245 aa  325  3e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.12072  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2471  transcriptional regulator  79.25 
 
 
238 aa  323  1e-87  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2435  transcriptional regulator  78.77 
 
 
238 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.412292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2480  transcriptional regulator  78.77 
 
 
238 aa  322  3e-87  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.337028  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11488  transcriptional regulator  80.48 
 
 
268 aa  308  4e-83  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0037779  normal  0.99088 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2382  regulatory protein ArsR  60.77 
 
 
274 aa  253  2.0000000000000002e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.307498  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16120  transcriptional regulator  54.34 
 
 
269 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.778634  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2275  putative transcriptional regulator  47.87 
 
 
237 aa  198  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00171437  normal  0.131971 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2510  putative transcriptional regulator  56.62 
 
 
236 aa  197  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1973  putative transcriptional regulator  53.4 
 
 
254 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.490943 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5155  putative transcriptional regulator  52.51 
 
 
238 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2549  transcriptional regulator  49.3 
 
 
240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.12553  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2223  putative transcriptional regulator  51.8 
 
 
280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000435551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5988  putative transcriptional regulator  51.2 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.423891  normal  0.331781 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2063  putative transcriptional regulator  48.64 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2262  putative transcriptional regulator  44.8 
 
 
253 aa  182  3e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.148405 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1134  putative transcriptional regulator  47.91 
 
 
273 aa  176  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.767556  normal  0.0484804 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3311  putative transcriptional regulator  47.25 
 
 
251 aa  173  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000054847 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2964  putative transcriptional regulator  49.27 
 
 
258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3084  regulatory protein, ArsR  46.08 
 
 
248 aa  169  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00550431  normal  0.268013 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1356  putative transcriptional regulator  47.12 
 
 
248 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2441  putative transcriptional regulator  46.85 
 
 
244 aa  157  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.47008  normal  0.125946 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1988  transcriptional regulator  48.53 
 
 
265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.625652  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21960  predicted transcriptional regulator  42.92 
 
 
275 aa  155  6e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153457  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1139  putative transcriptional regulator  41.43 
 
 
252 aa  151  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.140272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2084  putative transcriptional regulator  50.23 
 
 
291 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1659  putative transcriptional regulator  48.17 
 
 
308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.773243  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2918  putative transcriptional regulator  43.4 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2341  putative transcriptional regulator  42.33 
 
 
270 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.265482 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1844  putative transcriptional regulator  38.25 
 
 
271 aa  142  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000755788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13330  predicted transcriptional regulator  41.82 
 
 
238 aa  137  8.999999999999999e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.763143  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2102  transcriptional regulator  36.44 
 
 
289 aa  132  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.697253  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14610  predicted transcriptional regulator  40.35 
 
 
245 aa  132  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.330701  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1670  putative transcriptional regulator  39.81 
 
 
270 aa  108  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0587994  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11480  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 
209 aa  102  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.902569  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3726  putative transcriptional regulator  31.78 
 
 
212 aa  99.4  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.110577  hitchhiker  0.00164762 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3238  putative transcriptional regulator  31.4 
 
 
211 aa  92.4  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.990793 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3451  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 
217 aa  81.3  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.225926  hitchhiker  0.00000000543336 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2493  putative transcriptional regulator  27.05 
 
 
211 aa  80.9  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0117208  normal  0.769487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1570  putative transcriptional regulator  29.76 
 
 
219 aa  79  0.00000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.417601  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4828  DeoR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00756639  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4669  DeoR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5193  DeoR family transcriptional regulator  24.64 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.076054  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5102  transcriptional regulator, DeoR family  24.64 
 
 
210 aa  76.3  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.211932  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5064  transcriptional regulator, DeoR family  24.64 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4686  DeoR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
210 aa  75.9  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000645179  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2060  MarR family transcriptional regulator  30.14 
 
 
235 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000547125  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2284  transcriptional regulator  28.5 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.123055 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1733  transcriptional regulator  30.7 
 
 
214 aa  75.1  0.0000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.86463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5097  DeoR family transcriptional regulator  24.15 
 
 
210 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1080  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0425  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 
219 aa  74.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.973468  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4354  transcriptional regulator  25.33 
 
 
228 aa  73.6  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3176  transcriptional regulator  25.59 
 
 
206 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0414  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 
219 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5103  transcriptional regulator, DeoR family  23.19 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.411801  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3584  hypothetical protein  26.07 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2998  transcriptional regulator  25.59 
 
 
206 aa  72.8  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00441752  normal  0.169259 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3079  transcriptional regulator  25.59 
 
 
206 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0625169  normal  0.749503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1011  putative transcriptional regulator  25.67 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1711  putative transcriptional regulator  30.48 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.42173  normal  0.540015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4781  putative transcriptional regulator  24.15 
 
 
210 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1113  putative transcriptional regulator  26.2 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00818822 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3278  putative transcriptional regulator  26.74 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0971152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0423  transcriptional regulator  27.27 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956901  normal  0.107177 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2786  putative transcriptional regulator  28.08 
 
 
208 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.788805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1018  putative transcriptional regulator  25 
 
 
210 aa  69.7  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3558  putative transcriptional regulator  24.27 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0136  transcriptional regulator, DeoR family  22.22 
 
 
210 aa  69.3  0.00000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.790585  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03001  regulatory proteins, AsnC family protein  25.67 
 
 
215 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.764788 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3070  transcriptional regulator, TrmB  25.98 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.272047 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0091  hypothetical protein  23.78 
 
 
205 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2387  transcriptional regulator protein-like protein  26.8 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.328356  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0028  transcriptional regulator  29.3 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.572077  normal  0.204969 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001755  predicted transcriptional regulator  22.71 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0263515  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1246  putative transcriptional regulator  24.64 
 
 
203 aa  64.3  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.628425 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0795  putative transcriptional regulator  25.82 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.164821  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0435  putative transcriptional regulator  27.47 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.341746  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2175  transcriptional regulator TrmB  27.18 
 
 
203 aa  62  0.000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.168136  normal  0.574645 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00716  hypothetical protein  21.74 
 
 
204 aa  62  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0402  putative transcriptional regulator  29.28 
 
 
214 aa  61.2  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0707  transcriptional regulator, TrmB  31.03 
 
 
209 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0414  putative transcriptional regulator  25.24 
 
 
220 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.802259  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1452  putative transcriptional regulator  25.62 
 
 
217 aa  60.1  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.293298  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0303  transcriptional regulator, TrmB  28.64 
 
 
209 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.117195 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0995  hypothetical protein  24.43 
 
 
206 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0961  putative transcriptional regulator  27.27 
 
 
225 aa  58.9  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.189509  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2239  hypothetical protein  23.15 
 
 
205 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3358  putative transcriptional regulator  25.12 
 
 
220 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0338727  normal  0.270871 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1289  hypothetical protein  24.88 
 
 
253 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0915  putative transcriptional regulator  25.79 
 
 
218 aa  56.6  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.949391 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0896  putative transcriptional regulator  25.37 
 
 
207 aa  56.6  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.610602 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38980  predicted transcriptional regulator  31.67 
 
 
227 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.224928 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4804  putative transcriptional regulator  23.7 
 
 
210 aa  56.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000646734 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0030  hypothetical protein  25.24 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0384  hypothetical protein  25.24 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1579  hypothetical protein  25.24 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.145631  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1200  hypothetical protein  25.24 
 
 
223 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108281  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0018  putative transcriptional regulator  23.88 
 
 
214 aa  54.7  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>