More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1721 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1721  Aldehyde Dehydrogenase  100 
 
 
481 aa  979    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0841  aldehyde dehydrogenase  72.86 
 
 
478 aa  686    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1553  Aldehyde Dehydrogenase  72.18 
 
 
477 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.27843  normal  0.0395835 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0279  betaine-aldehyde dehydrogenase  68.99 
 
 
484 aa  665    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2320  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
477 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.694808  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2312  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
477 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.00319664  normal  0.870052 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3397  Aldehyde Dehydrogenase  73.28 
 
 
483 aa  700    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.938328  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2580  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  70.28 
 
 
477 aa  652    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00346459  normal  0.181032 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3819  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.85 
 
 
477 aa  681    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2273  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  69.77 
 
 
477 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2917  aldehyde dehydrogenase  73.89 
 
 
479 aa  700    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3222  aldehyde dehydrogenase  68.84 
 
 
477 aa  675    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.962523  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1285  aldehyde dehydrogenase  70.98 
 
 
478 aa  674    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.019381  normal  0.275574 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1008  aldehyde dehydrogenase  67.09 
 
 
477 aa  632  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.8811  normal  0.211569 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4938  Aldehyde Dehydrogenase  67.44 
 
 
480 aa  628  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  67.16 
 
 
476 aa  625  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00255775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1552  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  66.53 
 
 
479 aa  626  1e-178  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.154954  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0573  Aldehyde Dehydrogenase  67.44 
 
 
476 aa  619  1e-176  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.102043  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0951  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.43 
 
 
506 aa  608  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0829268  normal  0.201547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  65.26 
 
 
485 aa  601  1.0000000000000001e-171  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1092  aldehyde dehydrogenase  62.47 
 
 
479 aa  580  1e-164  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1495  Aldehyde Dehydrogenase  65.75 
 
 
480 aa  569  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3095  aldehyde dehydrogenase  59.16 
 
 
476 aa  571  1e-161  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0472146  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2799  Aldehyde Dehydrogenase  59.16 
 
 
476 aa  553  1e-156  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00208609 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2245  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  57.41 
 
 
479 aa  519  1e-146  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.287258  normal  0.81979 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0152  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
480 aa  519  1e-146  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7454  Aldehyde Dehydrogenase  56.93 
 
 
472 aa  516  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0272918  normal  0.363977 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4237  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  56.44 
 
 
482 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.279293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2413  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.89 
 
 
481 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.8196  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2606  aldehyde dehydrogenase  62.96 
 
 
457 aa  511  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3427  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.29 
 
 
475 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.852942  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1044  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  52 
 
 
474 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.973178  normal  0.50904 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3727  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
475 aa  490  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3642  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.61 
 
 
474 aa  484  1e-135  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2191  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.75 
 
 
475 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.011957 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1818  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.08 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2124  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.64 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.775218 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2792  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.75 
 
 
474 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1415  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.87 
 
 
474 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1481  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
474 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.825614  normal  0.424328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1087  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  52.21 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.413217 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4240  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
474 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35880  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.33 
 
 
474 aa  464  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00355569  hitchhiker  2.4674200000000003e-18 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2601  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
486 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2801  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1715  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.78365 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1777  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4136  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.13 
 
 
474 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2390  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  53.93 
 
 
486 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.277695  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1563  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.58 
 
 
481 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2110  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  54.04 
 
 
476 aa  461  9.999999999999999e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.500733  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1712  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.37 
 
 
481 aa  457  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1744  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.16 
 
 
481 aa  455  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.285549  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1729  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.79 
 
 
474 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000210519 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.48 
 
 
478 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2215  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
474 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01401  medium chain aldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
474 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2202  1-pyrroline dehydrogenase  49.05 
 
 
474 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.211355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2050  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.85 
 
 
474 aa  449  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000200583 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1624  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.26 
 
 
474 aa  451  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1049  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.01 
 
 
495 aa  451  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01412  hypothetical protein  49.05 
 
 
474 aa  451  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3304  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
477 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.154933 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1528  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.05 
 
 
474 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1303  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.54 
 
 
474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000359422  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3647  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.08 
 
 
487 aa  444  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7700  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.27 
 
 
475 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2741  Aldehyde Dehydrogenase  49.27 
 
 
492 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2092  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  51.09 
 
 
470 aa  420  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4860  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.07 
 
 
491 aa  417  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0955697 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0561  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  46.53 
 
 
490 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1857  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
470 aa  412  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00107928  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0531  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
514 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7094  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  47.18 
 
 
491 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16823  normal  0.313515 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0435  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  50.11 
 
 
514 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2162  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.67 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00684658  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1451  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.67 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0846  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  49.67 
 
 
470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.168911  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1572  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.06 
 
 
490 aa  395  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.116307  normal  0.721835 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0985  Aminobutyraldehyde dehydrogenase  50 
 
 
463 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3584  Aldehyde Dehydrogenase  48.21 
 
 
496 aa  392  1e-108  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1247  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 
502 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.791196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1237  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 
523 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.399844  normal  0.627262 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1220  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  48.71 
 
 
523 aa  385  1e-106  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1807  gamma-aminobutyraldehyde dehydrogenase  45.7 
 
 
468 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2487  aldehyde dehydrogenase family protein  39.71 
 
 
503 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1556  Retinal dehydrogenase  39.92 
 
 
490 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3759  Aldehyde Dehydrogenase  38.66 
 
 
490 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.304272 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3562  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.26 
 
 
494 aa  345  1e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37194  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2904  aldehyde dehydrogenase  39.79 
 
 
494 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399829  normal  0.436531 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5059  betaine aldehyde dehydrogenase  41.58 
 
 
489 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0560116 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18440  Aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 
499 aa  337  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.931316  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2738  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  39.75 
 
 
488 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5036  betaine aldehyde dehydrogenase  41.34 
 
 
489 aa  335  7e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.418531  normal  0.930048 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3431  betaine-aldehyde dehydrogenase  39.75 
 
 
488 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4086  aldehyde dehydrogenase  39.54 
 
 
488 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.515709  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4688  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
500 aa  333  4e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5502  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
500 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1591  betaine aldehyde dehydrogenase  40.75 
 
 
489 aa  333  4e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3586  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.59 
 
 
500 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>