31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0209 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0209  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
146 aa  294  3e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.899244  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2303  hypothetical protein  36.69 
 
 
139 aa  95.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1265  Polyketide cyclase/dehydrase  31.88 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0100939 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3537  Polyketide cyclase/dehydrase  32.89 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.642058  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4582  hypothetical protein  32.85 
 
 
174 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.165656 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.52 
 
 
152 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2430  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000184425  hitchhiker  0.00000753346 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2804  hypothetical protein  30.77 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.892543  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7539  hypothetical protein  33.57 
 
 
169 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.726082 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3170  hypothetical protein  30.88 
 
 
155 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2766  hypothetical protein  30.88 
 
 
159 aa  53.5  0.0000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.257584 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2008  hypothetical protein  30.14 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1675  hypothetical protein  31.11 
 
 
164 aa  52.8  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1166  Polyketide cyclase/dehydrase  29.45 
 
 
148 aa  51.6  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0805465  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0836  hypothetical protein  28.07 
 
 
146 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2609  hypothetical protein  30.28 
 
 
162 aa  50.4  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0546074  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3264  cyclase/dehydrase  29.71 
 
 
140 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.302444  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8396  hypothetical protein  28.67 
 
 
151 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.571657  normal  0.617254 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3938  hypothetical protein  33.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0590481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  32.14 
 
 
185 aa  49.3  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  31.21 
 
 
141 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4528  hypothetical protein  24.11 
 
 
156 aa  43.5  0.0009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0311362 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1383  activator of HSP90 ATPase 1 family protein  30.23 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0448343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  34.67 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4393  hypothetical protein  32.52 
 
 
151 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00463906  normal  0.793134 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0154  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0145  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.510568  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7124  hypothetical protein  26.56 
 
 
139 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.819313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0842  hypothetical protein  26.79 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0158  hypothetical protein  28.07 
 
 
150 aa  40.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000705045  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1397  hypothetical protein  25.37 
 
 
147 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000428028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>