More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2922 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2922  putative lipoprotein  100 
 
 
285 aa  570  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000434521 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2200  putative lipoprotein  40.07 
 
 
296 aa  199  3e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.31625  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3365  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  40.28 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.432106  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1314  putative lipoprotein  39.34 
 
 
298 aa  194  2e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3343  putative lipoprotein  39.7 
 
 
267 aa  191  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.911253  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1504  lipoprotein, putative  37.87 
 
 
298 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39340  AB-hydrolase-lipoprotein  43.2 
 
 
295 aa  187  2e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4222  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  39.77 
 
 
286 aa  183  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.917289 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1500  putative lipoprotein  39.15 
 
 
307 aa  178  7e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.313802  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16600  alpha/beta family hydrolase  40.68 
 
 
301 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579607  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1064  putative lipoprotein  38.13 
 
 
304 aa  176  4e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.219682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4117  lipoprotein  39.92 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1105  lipoprotein  39 
 
 
307 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1443  putative lipoprotein  40.71 
 
 
301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2909  hypothetical protein  29.31 
 
 
284 aa  133  3e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00394962  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1143  putative enzyme  29.31 
 
 
284 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02426  predicted peptidase  31.43 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.643238  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1134  putative enzyme  28.52 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2686  hypothetical protein  28.52 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00504077  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2819  hypothetical protein  28.52 
 
 
284 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000321727  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02390  hypothetical protein  31.43 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.555868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3766  hypothetical protein  31.43 
 
 
284 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147795  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2687  hypothetical protein  28.97 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.441932  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2788  hypothetical protein  29.17 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0282632  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2747  hypothetical protein  30.48 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.282698  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2702  hypothetical protein  30.48 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0546858  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2809  hypothetical protein  30.48 
 
 
292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.522883  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2029  hypothetical protein  35.83 
 
 
276 aa  117  3e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1826  hypothetical protein  33.84 
 
 
282 aa  116  5e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.542435  hitchhiker  0.00448531 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0918  hypothetical protein  33.05 
 
 
271 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1053  alpha/beta hydrolase fold protein  35.32 
 
 
285 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2535  hypothetical protein  35.48 
 
 
274 aa  114  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.851232  normal  0.106899 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2092  hypothetical protein  31.6 
 
 
275 aa  113  4.0000000000000004e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2990  hypothetical protein  33.88 
 
 
282 aa  112  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.262308  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2384  Hydrolase of the alpha/beta superfamily-like protein  34.6 
 
 
297 aa  107  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.397135  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0900  phospholipase/Carboxylesterase  31.78 
 
 
306 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2657  hypothetical protein  29.7 
 
 
265 aa  104  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2424  putative enzyme (3.4.-)  30.86 
 
 
278 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2527  hypothetical protein  29.7 
 
 
265 aa  103  4e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2922  hypothetical protein  28.25 
 
 
270 aa  94  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0547167  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2331  hypothetical protein  33.6 
 
 
305 aa  92.4  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.978321  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3567  phospholipase/carboxylesterase  29.03 
 
 
290 aa  90.1  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.486808  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04550  lysophospholipase  28.98 
 
 
290 aa  89.7  5e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2614  phospholipase/Carboxylesterase  31.86 
 
 
307 aa  89.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4214  phospholipase/carboxylesterase  35.23 
 
 
295 aa  89  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03757  BEM46 family protein (AFU_orthologue; AFUA_7G04660)  30.13 
 
 
303 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.913854 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3502  phospholipase/Carboxylesterase  31.71 
 
 
307 aa  87.8  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4026  hypothetical protein  30.69 
 
 
278 aa  87  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.381754  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12329  hypothetical protein  30.31 
 
 
281 aa  86.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3582  alpha/beta hydrolase fold protein  28.46 
 
 
305 aa  85.1  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00156295  decreased coverage  0.0000136231 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0482  hydrolase of the alpha/beta superfamily  30.53 
 
 
272 aa  84  0.000000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0662813 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5033  hypothetical protein  28.7 
 
 
277 aa  84  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.816657  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7068  hypothetical protein  25.68 
 
 
267 aa  83.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0409  Alpha/beta hydrolase  26.17 
 
 
287 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.140246 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1322  hypothetical protein  32.28 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1782  dipeptidyl aminopeptidase/acylaminoacyl-peptidase-like protein  32.35 
 
 
314 aa  82.8  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.226072  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5537  Lysophospholipase-like protein  27.15 
 
 
266 aa  82.8  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.738502  normal  0.85419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1252  alpha/beta fold family hydrolase-like protein  29.67 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.696042  normal  0.518884 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2656  hypothetical protein  31.2 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.251758  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3572  hypothetical protein  29.22 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.455992  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0848  hypothetical protein  27.27 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3502  esterase/lipase/thioesterase family protein  33.91 
 
 
315 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2214  hypothetical protein  25.44 
 
 
313 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1313  peptidase S15  25.76 
 
 
294 aa  79.3  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0699  hypothetical protein  31.1 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.614085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2467  hypothetical protein  29.11 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0772677  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3344  hypothetical protein  29 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00702344 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0719  hypothetical protein  31.1 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.757483  normal  0.0283787 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0705  hypothetical protein  31.1 
 
 
275 aa  78.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1304  hypothetical protein  28.97 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196615  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3659  esterase/lipase/thioesterase family protein  32.31 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.951515  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3590  esterase/lipase/thioesterase family protein  34.35 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10362  predicted protein  28.36 
 
 
299 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203022  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2450  hydrolase with alpha/beta fold  24.91 
 
 
267 aa  77  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.805173 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1787  hypothetical protein  31.46 
 
 
282 aa  77  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.568084  normal  0.505933 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2421  hypothetical protein  27.13 
 
 
315 aa  75.9  0.0000000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1023  hypothetical protein  29.89 
 
 
274 aa  75.5  0.0000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.995394  normal  0.0462853 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1951  hypothetical protein  30.8 
 
 
314 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.896568  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2039  hypothetical protein  31.33 
 
 
279 aa  74.7  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1129  bem46 protein  29.59 
 
 
295 aa  73.2  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.578173  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3467  hypothetical protein  29.13 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.25166  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2325  hypothetical protein  30.7 
 
 
279 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00039839  decreased coverage  0.00000132224 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5147  hypothetical protein  30.85 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.252623 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2032  hypothetical protein  30.97 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.287773  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1297  hypothetical protein  30.63 
 
 
324 aa  70.5  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12258  normal  0.997754 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2532  hypothetical protein  27.4 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2272  hypothetical protein  29.32 
 
 
259 aa  70.1  0.00000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2910  peptidase S9, prolyl oligopeptidase active site region  31.25 
 
 
606 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2325  hypothetical protein  25.9 
 
 
309 aa  68.9  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1999  Dipeptidylaminopeptidase/acylaminoacyl- peptidase -like protein  33.87 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0236781  hitchhiker  0.00479184 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6855  hypothetical protein  29.5 
 
 
266 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3451  hypothetical protein  27.62 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6077  hypothetical protein  27.1 
 
 
268 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.326686  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1306  hypothetical protein  29.28 
 
 
280 aa  67.4  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2116  hypothetical protein  30.61 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.537851  normal  0.60451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2887  hypothetical protein  29.26 
 
 
294 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608912  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2695  hypothetical protein  26.64 
 
 
294 aa  65.9  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0601  dienelactone hydrolase  29.05 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2805  alpha/beta hydrolase  26.29 
 
 
307 aa  65.9  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.793976  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0443  hypothetical protein  29.12 
 
 
293 aa  65.5  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>