28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2576 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2576  cytochrome c family protein, putative  100 
 
 		 162 aa  331  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00231924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0721  FmdB family regulatory protein  75.46 
 
 		 164 aa  261  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.538439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2748  cytochrome c family protein, putative  72.84 
 
 		 181 aa  254  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3176  FmdB family regulatory protein  32.62 
 
 		 190 aa  81.6  0.000000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1521  FmdB family regulatory protein  31.25 
 
 		 141 aa  61.2  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.10251 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4161  FmdB family regulatory protein  30.77 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00024614  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3239  regulatory protein, FmdB family  29.57 
 
 		 129 aa  60.5  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.688496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3407  FmdB family regulatory protein  31.82 
 
 		 142 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.200356  normal  0.535647 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1903  FmdB family regulatory protein  33.96 
 
 		 121 aa  55.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.056161  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2281  regulatory protein, FmdB family  24.63 
 
 		 118 aa  47  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1219  regulatory protein, FmdB family  38.46 
 
 		 76 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000778963 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1501  hypothetical protein  38.46 
 
 		 76 aa  45.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1009  hypothetical protein  38.18 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0112421  normal  0.0977193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2352  FmdB family regulatory protein  28.72 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2673  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 66 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0890211  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2577  regulatory protein, FmdB family  42.86 
 
 		 66 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.923683  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2088  regulatory protein, FmdB family  40 
 
 		 79 aa  43.9  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0512  regulatory protein, FmdB family  38.3 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2310  regulatory protein, FmdB family  39.13 
 
 		 78 aa  43.1  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0545212 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1427  FmdB family regulatory protein  41.3 
 
 		 80 aa  42.4  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0056  regulatory protein, FmdB family  32 
 
 		 85 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00717185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0055  hypothetical protein  32 
 
 		 85 aa  42  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.130554  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1777  hypothetical protein  38.3 
 
 		 92 aa  42  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4413  hypothetical protein  45.65 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.945619  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2706  FmdB family regulatory protein  38.3 
 
 		 79 aa  41.2  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.589032 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3290  hypothetical protein  31.03 
 
 		 66 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0880  FmdB family regulatory protein  31.58 
 
 		 78 aa  40.4  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0842902 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0420  hypothetical protein  41.3 
 
 		 75 aa  40.8  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.865694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>