More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2151 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_2151  alcohol dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  730    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2823  6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  80.06 
 
 
357 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1431  6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  79.49 
 
 
357 aa  560  1e-158  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000103725  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2954  6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  71.27 
 
 
355 aa  506  9.999999999999999e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.34702  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4042  6-hydroxycyclohex-1-ene-1-carbonyl-CoA dehydrogenase  49.86 
 
 
355 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6215  alcohol dehydrogenase  31.03 
 
 
342 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.508121  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71630  alcohol dehydrogenase  31.32 
 
 
342 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.689289  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9223  alcohol dehydrogenase  29.45 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2461  alcohol dehydrogenase  29.46 
 
 
344 aa  120  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.806463  normal  0.872152 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07960  Zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily  29.02 
 
 
342 aa  120  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0120  alcohol dehydrogenase  35.19 
 
 
340 aa  119  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232442  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2912  zinc-binding alcohol dehydrogenase  29.14 
 
 
342 aa  119  6e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00450  Zn-dependent alcohol dehydrogenase  30.2 
 
 
348 aa  119  9e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147294  normal  0.0391491 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0774  alcohol dehydrogenase  28.34 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.623956  normal  0.377339 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0643  alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2868  alcohol dehydrogenase  29.83 
 
 
342 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0455356  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0628  alcohol dehydrogenase  30.98 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0028  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  32.21 
 
 
342 aa  117  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0233433  decreased coverage  0.000000000133046 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3048  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  28.36 
 
 
355 aa  115  8.999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3853  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.95 
 
 
336 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0910  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  30.24 
 
 
372 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.788021  normal  0.0507788 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3231  alcohol dehydrogenase  28 
 
 
344 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.232586  normal  0.423242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1078  alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.79 
 
 
345 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3322  alcohol dehydrogenase  28.78 
 
 
338 aa  112  8.000000000000001e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.596213  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0919  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.41 
 
 
351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3540  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
337 aa  111  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2394  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.85 
 
 
341 aa  111  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5450  alcohol dehydrogenase  27.12 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.524745  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0195  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.45 
 
 
344 aa  110  3e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0203  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.45 
 
 
344 aa  110  3e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2455  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30.09 
 
 
341 aa  110  3e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0402803  normal  0.851382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1501  alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
364 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0688996  normal  0.478377 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1693  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.69 
 
 
343 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2799  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  28.12 
 
 
364 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.331136  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1889  alcohol dehydrogenase  28.61 
 
 
343 aa  109  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4951  alcohol dehydrogenase  34.55 
 
 
337 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.179579  normal  0.722562 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5768  alcohol dehydrogenase  28.57 
 
 
342 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0272  alcohol dehydrogenase  27.46 
 
 
344 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  31.39 
 
 
346 aa  108  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18780  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  30.16 
 
 
362 aa  107  4e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.424094 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3494  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.06 
 
 
341 aa  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1719  alcohol dehydrogenase  30.64 
 
 
344 aa  107  5e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1967  alcohol dehydrogenase  27.35 
 
 
344 aa  106  6e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6852  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
340 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0730  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.36 
 
 
346 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.321547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3495  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  26.86 
 
 
350 aa  105  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1821  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.94 
 
 
342 aa  105  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.162011 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2367  alcohol dehydrogenase  29.34 
 
 
344 aa  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.305861 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2254  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.21 
 
 
349 aa  104  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.843055  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0523  alcohol dehydrogenase  25.83 
 
 
350 aa  104  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3387  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  29.89 
 
 
369 aa  104  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0945129  normal  0.744246 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5114  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  30 
 
 
369 aa  105  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0396  alcohol dehydrogenase  30.57 
 
 
352 aa  105  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0338  alcohol dehydrogenase  30.27 
 
 
351 aa  104  2e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0576668  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0536  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.19 
 
 
341 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3130  putative propanol-preferring alcohol dehydrogenase oxidoreductase protein  29.71 
 
 
341 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.320516  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3557  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.73 
 
 
341 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0283945  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1589  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  29.12 
 
 
341 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12287  zinc-type alcohol dehydrogenase adhE2  29.12 
 
 
361 aa  103  4e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2414  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  29.54 
 
 
369 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.847412  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3677  zinc-containing alcohol dehydrogenase superfamily protein  33.18 
 
 
342 aa  103  6e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.212434  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2771  putative dehydrogenase  26.92 
 
 
348 aa  102  7e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0527  putative Zinc-containing alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
344 aa  102  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4176  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.57 
 
 
350 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.653056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3391  alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
362 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.508569  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3380  zinc-binding alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
362 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.286497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3442  alcohol dehydrogenase  28.07 
 
 
362 aa  102  8e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.174666  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0885  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  26.65 
 
 
351 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1631  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.38 
 
 
335 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000205329  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0235  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
347 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0241  alcohol dehydrogenase  28.35 
 
 
347 aa  102  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0720  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.5 
 
 
342 aa  102  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.546912  normal  0.597384 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0914  alcohol dehydrogenase  27.17 
 
 
349 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1029  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.19 
 
 
356 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0432101  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1093  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  27.56 
 
 
342 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00417827 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1768  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  29.97 
 
 
347 aa  102  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000239978 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1829  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  28.49 
 
 
372 aa  102  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0359093  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1905  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  33.77 
 
 
336 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0108  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  29.62 
 
 
369 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3256  alcohol dehydrogenase  30.09 
 
 
345 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1990  alcohol dehydrogenase  29.39 
 
 
340 aa  101  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275067  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0210  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain-containing protein  29.1 
 
 
338 aa  101  2e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.835895  normal  0.242197 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1557  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase  28.73 
 
 
375 aa  101  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0408  mycothiol-dependent formaldehyde dehydrogenase  29.6 
 
 
361 aa  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3972  S-(hydroxymethyl)glutathione dehydrogenase/class III alcohol dehydrogenase  29.19 
 
 
372 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.98607 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1323  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  28.65 
 
 
346 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0428  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  27.87 
 
 
341 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.364327  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5308  alcohol dehydrogenase  25.79 
 
 
341 aa  100  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346008  normal  0.295753 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0173  alcohol dehydrogenase  26.06 
 
 
337 aa  100  3e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.976128  normal  0.272839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3448  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
347 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1871  alcohol dehydrogenase  26.49 
 
 
350 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.843746  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2008  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  27.12 
 
 
337 aa  100  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.590492  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3530  alcohol dehydrogenase  28.46 
 
 
376 aa  100  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425033 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3450  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
347 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1046  alcohol dehydrogenase, zinc-containing  28.45 
 
 
341 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2784  zinc-binding dehydrogenase family oxidoreductase  28.45 
 
 
341 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3556  galactitol-1-phosphate dehydrogenase  29.11 
 
 
347 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2341  alcohol dehydrogenase  33.33 
 
 
348 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5563  zinc-binding alcohol dehydrogenase  33.9 
 
 
356 aa  99.8  6e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187589  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0196  Alcohol dehydrogenase GroES domain protein  35.56 
 
 
357 aa  99.8  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>