More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2074 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2074  thiolase  100 
 
 		 391 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000106789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1460  acetyl-CoA acetyltransferase  76.21 
 
 		 391 aa  616  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.172514  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2794  acetyl-CoA acetyltransferase  76.73 
 
 		 391 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.456608 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3043  acetyl-CoA acetyltransferase  72.63 
 
 		 391 aa  584  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000975742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1719  thiolase  70.59 
 
 		 391 aa  561  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000100709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3574  acetyl-CoA acetyltransferase  71.21 
 
 		 392 aa  556  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.384269  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3302  thiolase  69.31 
 
 		 391 aa  555  1e-157  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2835  acetyl-CoA acetyltransferase  69.31 
 
 		 391 aa  554  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1378  acetyl-CoA acetyltransferase  69.05 
 
 		 391 aa  552  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433921 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2430  acetyl-CoA acetyltransferase  53.71 
 
 		 393 aa  396  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23640  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 		 392 aa  395  1e-109  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3820  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 392 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2011  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.271302  normal  0.806443 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0970  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3597  acetyl-CoA acetyltransferase  53.06 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.840519 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3293  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6443  acetyl-CoA acetyltransferase  48.85 
 
 		 392 aa  391  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1138  acetyl-CoA acetyltransferase  53.32 
 
 		 393 aa  392  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.495494 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38630  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 393 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752168  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1844  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.980991  normal  0.0817271 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0803  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 		 392 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0515651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2901  acetyl-CoA acetyltransferase  52.07 
 
 		 395 aa  387  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.255971  normal  0.0133892 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2256  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 393 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0160796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2058  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 		 395 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2187  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0311845  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5091  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6102  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0543  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1484  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226113  normal  0.0550721 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2342  acetyl-CoA acetyltransferase  51.53 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0411622 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1814  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.390128 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2158  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6289  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3662  acetyl-CoA acetyltransferase  50.13 
 
 		 391 aa  382  1e-105  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1910  acetyl-CoA acetyltransferase  49.23 
 
 		 393 aa  382  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.126312 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2460  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 392 aa  382  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2170  acetyl-CoA acetyltransferase  52.04 
 
 		 392 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2165  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.810092  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1790  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 393 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2772  acetyl-CoA acetyltransferase  51.15 
 
 		 393 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2202  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0577057  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1632  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.871042  normal  0.67085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4498  acetyl-CoA acetyltransferase  51.91 
 
 		 392 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.231134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2783  acetyl-CoA acetyltransferase  51.03 
 
 		 396 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.184491  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1525  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1788  hypothetical protein  50.64 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1789  hypothetical protein  50.38 
 
 		 394 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1182  putative acyl-CoA thiolase  49.36 
 
 		 391 aa  379  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2330  acetyl-CoA acetyltransferase  50.77 
 
 		 393 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.2487  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1495  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1473  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.35 
 
 		 396 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066272 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1397  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2923  acetyl-CoA acetyltransferases  50.77 
 
 		 394 aa  380  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.709374  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2856  acetyl-CoA acetyltransferase  50.65 
 
 		 396 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.700785  hitchhiker  0.0000000577054 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1081  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.201222  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1701  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2117  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 393 aa  376  1e-103  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.465032  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4636  acetyl-CoA acetyltransferase  51.4 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0957  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 392 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1489  acetyl-CoA acetyltransferase  50.39 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1321  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.177108  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1869  acetyl-CoA acetyltransferase  52.17 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101968 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0824  acetyl-CoA acetyltransferase  51.02 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.122225  hitchhiker  0.00529979 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01744  acetoacetyl-CoA thiolase  52.43 
 
 		 391 aa  378  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.569718  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02410  acetyl-CoA acetyltransferase with thiolase domain  51.04 
 
 		 416 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3202  acetyl-CoA acetyltransferase  48.06 
 
 		 400 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.573759  hitchhiker  0.000000552223 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1943  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.61 
 
 		 396 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1667  acetyl-CoA acetyltransferase  49.87 
 
 		 396 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00240927  normal  0.0395085 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000375  3-ketoacyl-CoA thiolase (isoleucine degradation)  47.94 
 
 		 392 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.587204  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0086  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1594  acetyl-CoA acetyltransferase  51.67 
 
 		 393 aa  375  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2691  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0402057  normal  0.140925 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1810  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  378  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0254268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1338  acetyl-CoA acetyltransferases  49.87 
 
 		 396 aa  378  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.671481  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1728  acetyl-CoA acetyltransferase  52.55 
 
 		 393 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244441  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1915  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0319596 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1499  acetyl-CoA acetyltransferase  51.41 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3601  acetyl-CoA acetyltransferase  50.38 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0916866  normal  0.155307 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0252  putative acetyl-CoA acyltransferase  49.22 
 
 		 393 aa  373  1e-102  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.152844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1348  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 393 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1587  acetyl-CoA acetyltransferase  50 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.019286 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1375  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  49.61 
 
 		 392 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.692424  normal  0.0264446 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2365  Acetyl-CoA C-acetyltransferase  51.16 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.828217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2696  acetyl-CoA acetyltransferase  49.36 
 
 		 394 aa  373  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0145764  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3162  acetyl-CoA acetyltransferase  48.98 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2140  acetyl-CoA acetyltransferase  50.26 
 
 		 392 aa  374  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1514  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 394 aa  372  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.113339  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2597  acetyl-CoA acetyltransferases  48.58 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.124801  hitchhiker  0.0000511139 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2664  acetyl-CoA acetyltransferases  48.58 
 
 		 396 aa  372  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.304657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2824  acetyl-CoA acetyltransferase  52.3 
 
 		 393 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13090  putative acyl-CoA thiolase  49.87 
 
 		 391 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51590  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1677  acetyl-CoA acetyltransferase  49.35 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4629  acetyl-CoA acetyltransferase  50.51 
 
 		 392 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.817149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1784  acetyl-CoA acetyltransferase  48.97 
 
 		 394 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3149  phosphoryl transfer system, HPr  49.23 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2073  acetyl-CoA acetyltransferase  51.28 
 
 		 392 aa  369  1e-101  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.68652  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1357  acetyl-CoA acetyltransferase  49.49 
 
 		 393 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2771  acetyl-CoA acetyltransferases  48.84 
 
 		 396 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384582 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>