27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0576 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0576  hypothetical protein  100 
 
 		 1284 aa  2607    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3541  hypothetical protein  61.25 
 
 		 1538 aa  241  6.999999999999999e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2869  cytochrome C family protein  36.12 
 
 		 1196 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00106509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1155  hypothetical protein  59.75 
 
 		 1537 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0120  cytochrome C family protein  40.23 
 
 		 2026 aa  160  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.345457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  39.32 
 
 		 1438 aa  147  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3561  Fibronectin type III domain protein  37.07 
 
 		 2178 aa  134  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0702  cytochrome c family protein  33.22 
 
 		 1916 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0571  cytochrome c family protein  40.61 
 
 		 1848 aa  118  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0077  cytochrome C family protein  43.58 
 
 		 2499 aa  108  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2898  high-molecular-weight cytochrome c  37.58 
 
 		 2803 aa  100  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0581  high-molecular-weight cytochrome c  29.46 
 
 		 2912 aa  94  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1157  hypothetical protein  45.03 
 
 		 642 aa  82.8  0.00000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0259  hypothetical protein  30.54 
 
 		 571 aa  81.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3417  cytochrome C family protein  36.84 
 
 		 939 aa  75.1  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000650224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0500  cytochrome C family protein  31.41 
 
 		 1496 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00446809  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4123  hypothetical protein  24.14 
 
 		 867 aa  69.7  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.751865 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0075  cytochrome C family protein  28.16 
 
 		 2222 aa  61.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3158  cytochrome C family protein  24.33 
 
 		 597 aa  59.3  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1197  hypothetical protein  27.58 
 
 		 392 aa  58.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.336279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0741  hypothetical protein  24.84 
 
 		 645 aa  57.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0951377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2754  hypothetical protein  25.79 
 
 		 584 aa  55.1  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1922  hypothetical protein  24.18 
 
 		 365 aa  51.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.058043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1786  cytochrome c family protein  27.1 
 
 		 363 aa  50.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.999993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3108  cytochrome c family protein  25.98 
 
 		 553 aa  49.3  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3226  cytochrome c family protein  26.95 
 
 		 576 aa  48.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0601  hypothetical protein  30.18 
 
 		 349 aa  45.8  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000425855  normal  0.13133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>