More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2121 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_2121  CheW protein  100 
 
 		 253 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3144  putative CheW protein  42.32 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2309  CheW protein  43.14 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2220  chemotaxis protein CheW  52.94 
 
 		 159 aa  156  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0757  CheW protein  40.64 
 
 		 276 aa  145  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0202103 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0742  CheW protein  41.75 
 
 		 275 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1730  CheW protein  40.91 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  34.93 
 
 		 183 aa  112  6e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  32.03 
 
 		 165 aa  110  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3106  CheW protein  35.57 
 
 		 165 aa  110  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  40 
 
 		 159 aa  108  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  35.62 
 
 		 170 aa  107  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  38.3 
 
 		 167 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  36.43 
 
 		 158 aa  107  2e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  38.89 
 
 		 165 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  35.07 
 
 		 162 aa  106  3e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  37.76 
 
 		 167 aa  106  4e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  36.3 
 
 		 159 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  37.4 
 
 		 147 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  33.57 
 
 		 168 aa  105  5e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.37 
 
 		 164 aa  105  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  35.48 
 
 		 158 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01858  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.017881  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  105  9e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  34.33 
 
 		 164 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2465  purine-binding chemotaxis protein  37.5 
 
 		 167 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  36.13 
 
 		 158 aa  103  3e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  34.07 
 
 		 168 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  36.81 
 
 		 165 aa  101  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3142  putative CheW protein  36.11 
 
 		 160 aa  101  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  36.96 
 
 		 165 aa  101  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2180  purine-binding chemotaxis protein  36.81 
 
 		 167 aa  101  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.735055  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  36.96 
 
 		 165 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  36.81 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  38 
 
 		 163 aa  100  3e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2040  CheW protein  35.29 
 
 		 158 aa  99.8  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  36.81 
 
 		 165 aa  100  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  36.81 
 
 		 165 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  36.81 
 
 		 165 aa  100  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0928  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1984  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2141  chemotaxis protein CheW2  37.58 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.183407  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  32.43 
 
 		 164 aa  99.4  5e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0231  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2003  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.967945  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1570  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 170 aa  99.4  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0789103  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  36.11 
 
 		 167 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  36.11 
 
 		 167 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  36.11 
 
 		 167 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  36.11 
 
 		 167 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  36.11 
 
 		 167 aa  99.4  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  36.17 
 
 		 145 aa  99  7e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1129  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 158 aa  98.6  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.127298  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  36.05 
 
 		 158 aa  98.6  9e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  33.96 
 
 		 175 aa  98.6  9e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2373  chemotaxis protein CheW  37.58 
 
 		 158 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.158617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0991  CheW protein  36.6 
 
 		 174 aa  98.6  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  34.97 
 
 		 164 aa  97.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  35.1 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  37.68 
 
 		 163 aa  97.8  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04752  chemotaxis protein  36.88 
 
 		 171 aa  97.1  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.841581  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3681  purine-binding chemotaxis protein  37.96 
 
 		 183 aa  97.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.501979  normal  0.0481885 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  37.86 
 
 		 163 aa  97.4  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  35.76 
 
 		 174 aa  97.4  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2144  chemotaxis protein cheW  36.17 
 
 		 175 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.929583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  39.13 
 
 		 169 aa  96.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  35.1 
 
 		 171 aa  96.7  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  36.23 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  36.23 
 
 		 177 aa  96.7  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0924  CheW protein  37.01 
 
 		 174 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  36.23 
 
 		 171 aa  96.3  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1935  CheW protein  33.11 
 
 		 174 aa  96.3  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65855  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  36.23 
 
 		 171 aa  96.3  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  33.33 
 
 		 175 aa  95.9  6e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  35.29 
 
 		 171 aa  95.5  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  35.56 
 
 		 150 aa  95.5  8e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  37.59 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0878  CheW protein  34.35 
 
 		 192 aa  95.1  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00285186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  37.59 
 
 		 194 aa  94.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  39.44 
 
 		 160 aa  94.4  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  36.76 
 
 		 178 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  36.76 
 
 		 178 aa  94  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3690  CheW protein  37.14 
 
 		 164 aa  94  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00616734  normal  0.0201727 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  30.66 
 
 		 165 aa  93.6  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2307  CheW protein  36.76 
 
 		 164 aa  93.6  3e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2175  CheW protein  33.61 
 
 		 166 aa  93.6  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.765903  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  34.16 
 
 		 175 aa  93.2  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  30.66 
 
 		 165 aa  93.6  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>