More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1890 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1890  histidine kinase  100 
 
 		 384 aa  793    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00251613  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2189  sensor histidine kinase  49.07 
 
 		 395 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2728  histidine kinase  48.9 
 
 		 387 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2287  histidine kinase  46.38 
 
 		 387 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000635078  normal  0.170007 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2970  histidine kinase  43.73 
 
 		 386 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1375  histidine kinase  43.43 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3006  histidine kinase  38.93 
 
 		 394 aa  253  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2053  histidine kinase  41.87 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2934  histidine kinase  40.6 
 
 		 390 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.257215 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1696  histidine kinase  36.92 
 
 		 380 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0566842  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2301  histidine kinase  37.11 
 
 		 386 aa  233  3e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229596 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0880  histidine kinase  37.47 
 
 		 374 aa  230  3e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216006 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1412  histidine kinase  38.68 
 
 		 381 aa  224  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.560761  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3366  histidine kinase  37.73 
 
 		 374 aa  224  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0902  histidine kinase  36.44 
 
 		 399 aa  224  3e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000164355  hitchhiker  0.00000000561176 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0278  histidine kinase  38.73 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.284649  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2687  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.43 
 
 		 377 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3335  histidine kinase  36.27 
 
 		 404 aa  207  3e-52  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248975  normal  0.715398 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1030  histidine kinase  29.29 
 
 		 261 aa  77  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.975788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2351  histidine kinase  29.11 
 
 		 399 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4160  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.19 
 
 		 516 aa  69.7  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0592  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.22 
 
 		 516 aa  69.3  0.0000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1033  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.14 
 
 		 557 aa  66.6  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1490  sensor histidine kinase KinD  29.17 
 
 		 498 aa  66.2  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1449  sensor histidine kinase KinD  28.7 
 
 		 498 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1949  putative 2-component sensor protein  29.14 
 
 		 470 aa  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.610571  normal  0.744525 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00585  nitrogen regulation protein NR(II)  26.46 
 
 		 336 aa  65.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3929  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.8 
 
 		 346 aa  64.7  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1565  histidine kinase  27.91 
 
 		 555 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0242212 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1059  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 498 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4825  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.2 
 
 		 799 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.976806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 		 458 aa  63.5  0.000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0183  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.45 
 
 		 390 aa  63.5  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1993  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.9 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.61631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1885  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0302487  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1970  histidine kinase  30 
 
 		 502 aa  63.2  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1225  sensor histidine kinase; sporulation kinase  27.01 
 
 		 498 aa  62.8  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.485232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1227  sensor histidine kinase; sporulation kinase  27.01 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  29.05 
 
 		 234 aa  62.8  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3957  sensor histidine kinase KinD  28.64 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.5608 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.67 
 
 		 827 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4077  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134335  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1424  sensor histidine kinase KinD  27.01 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00267919 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4289  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1912  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 		 201 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.436176  unclonable  0.00000739148 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3228  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 494 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.8274  normal  0.13211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001907  nitrogen regulation protein NR(II)  26.12 
 
 		 348 aa  62.4  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0104  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.33 
 
 		 367 aa  61.6  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1730  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0905  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.65 
 
 		 774 aa  61.6  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.226148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0201  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 408 aa  60.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2403  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.94 
 
 		 371 aa  60.8  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1252  sensor histidine kinase KinD  27.01 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1351  sensor histidine kinase KinD  27.01 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.7 
 
 		 1291 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1250  histidine kinase  28.17 
 
 		 498 aa  60.8  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.792826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2855  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.51 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1387  sensor histidine kinase KinD  28.17 
 
 		 498 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0483  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.36 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0083  histidine kinase  23.47 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0423  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  27.75 
 
 		 462 aa  60.1  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  31.08 
 
 		 367 aa  59.7  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1794  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 589 aa  59.7  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000132214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3740  histidine kinase  27.53 
 
 		 616 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1500  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.99 
 
 		 590 aa  59.7  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.53 
 
 		 738 aa  59.7  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.51 
 
 		 627 aa  58.9  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0656  histidine kinase  28.99 
 
 		 417 aa  59.3  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.572092 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4312  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.56 
 
 		 640 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0871  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  25.19 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0383  histidine kinase  30.61 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.614278  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4185  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 482 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0670808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2698  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4177  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 490 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3741  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.49679  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3707  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 482 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1918  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.75 
 
 		 535 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.723955  normal  0.316434 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.33 
 
 		 598 aa  57.8  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4504  nitrogen regulation protein NR(II)  30.04 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.456995  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4221  nitrogen regulation protein NR(II)  30.04 
 
 		 349 aa  57.8  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314539  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2815  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.07 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2820  histidine kinase  25.2 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.07 
 
 		 585 aa  57.4  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4316  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.49 
 
 		 485 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.500539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 987 aa  57.8  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3129  histidine kinase  26.03 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8765  Histidine kinase  26.07 
 
 		 593 aa  57.4  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0089  histidine kinase  25.52 
 
 		 382 aa  57.4  0.0000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.64 
 
 		 519 aa  57.4  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4097  nitrogen regulation protein NR(II)  27.27 
 
 		 349 aa  57  0.0000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.744488 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1216  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.26 
 
 		 357 aa  57  0.0000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0619  histidine kinase  30.5 
 
 		 313 aa  57  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0481  response regulator receiver protein  26.77 
 
 		 523 aa  57  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0830  histidine kinase  24.55 
 
 		 401 aa  57  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  28.7 
 
 		 367 aa  57  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0041  sensor histidine kinase  29.71 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.708956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1741  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  28.05 
 
 		 461 aa  57  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300317  normal  0.393073 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3521  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1022 aa  57  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>