27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1282 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1282  type II secretory pathway component PulC-like protein  100 
 
 		 288 aa  566  1e-160  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0684  Type II secretory pathway component PulC-like protein  55.07 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000617001  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0611  type II secretory pathway component PulC-like protein  53.18 
 
 		 296 aa  281  7.000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.78694e-21 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0597  type II secretory pathway component PulC-like protein  54.55 
 
 		 296 aa  275  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.150612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3363  PDZ/DHR/GLGF  56.85 
 
 		 290 aa  257  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000344087  hitchhiker  0.00365094 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0330  general secretion pathway protein C, putative  49.66 
 
 		 291 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70188  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2607  general secretion pathway protein C  25.86 
 
 		 317 aa  87  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.144051  normal  0.867603 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0721  hypothetical protein  34 
 
 		 327 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0722  hypothetical protein  34 
 
 		 327 aa  85.5  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.245485  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0687  hypothetical protein  34 
 
 		 327 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.259816  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0731  hypothetical protein  34 
 
 		 342 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0148909  normal  0.986214 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1040  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  22.89 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000638276  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1559  hypothetical protein  28.8 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.507432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1178  PDZ/DHR/GLGF domain protein  28.44 
 
 		 261 aa  55.5  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.803619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2402  general secretion pathway protein C  24.86 
 
 		 328 aa  53.9  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.237406  hitchhiker  0.00100026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0230  general secretion pathway protein C  33.82 
 
 		 284 aa  53.5  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03955  general secretion pathway protein C  31.17 
 
 		 307 aa  49.7  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0224  general secretion pathway protein C  23.79 
 
 		 302 aa  49.3  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4592  general secretion pathway protein C  30.28 
 
 		 316 aa  47.4  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3516  protease Do  39.39 
 
 		 537 aa  45.8  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.277095 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3581  general secretion pathway protein C  30.77 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.703805  normal  0.317854 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  29.13 
 
 		 492 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1125  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.18 
 
 		 523 aa  43.5  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.33278  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  29.13 
 
 		 492 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2925  general secretion pathway protein C  30.99 
 
 		 303 aa  43.1  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00600  zinc metallopeptidase  29.87 
 
 		 307 aa  42.7  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  28.16 
 
 		 490 aa  42.4  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>