More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2906 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2906  methionine aminopeptidase, type I  100 
 
 
263 aa  540  1e-153  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.320863  normal  0.193027 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1492  methionine aminopeptidase, type I  68.9 
 
 
261 aa  377  1e-103  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2600  methionine aminopeptidase, type I  65.77 
 
 
273 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0881551  normal  0.201576 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4833  methionine aminopeptidase, type I  67.72 
 
 
279 aa  366  1e-100  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0117  methionine aminopeptidase, type I  68.65 
 
 
271 aa  360  1e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0058  methionine aminopeptidase, type I  63.53 
 
 
274 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0392  methionine aminopeptidase, type I  63.92 
 
 
274 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0155  methionine aminopeptidase, type I  63.14 
 
 
274 aa  358  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.368202  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3793  methionine aminopeptidase, type I  63.5 
 
 
276 aa  356  1.9999999999999998e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0861362  unclonable  0.000000166393 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0733  methionine aminopeptidase, type I  65.5 
 
 
271 aa  355  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.801618  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2076  methionine aminopeptidase, type I  65.75 
 
 
277 aa  355  3.9999999999999996e-97  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0336  peptidase M24A  63.14 
 
 
271 aa  349  2e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.575724  normal  0.771831 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2469  methionine aminopeptidase, type I  65.52 
 
 
271 aa  349  3e-95  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.76233  normal  0.0281662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1455  methionine aminopeptidase  61.8 
 
 
274 aa  348  4e-95  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.519958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2993  methionine aminopeptidase, type I  65.48 
 
 
293 aa  348  4e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0922549 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0923  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
293 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.143521  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2582  methionine aminopeptidase, type I  65.87 
 
 
293 aa  348  5e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.998026 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1710  methionine aminopeptidase  65.08 
 
 
278 aa  348  6e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.760882  normal  0.720005 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2897  methionine aminopeptidase, type I  64.96 
 
 
277 aa  347  1e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.231581 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1644  methionine aminopeptidase, type I  64.17 
 
 
274 aa  346  2e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.828935  normal  0.0725302 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1044  methionine aminopeptidase, type I  64.31 
 
 
279 aa  346  2e-94  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.27507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1110  methionine aminopeptidase, type I  63.78 
 
 
283 aa  345  4e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.249356  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0431  methionine aminopeptidase, type I  61.18 
 
 
274 aa  345  6e-94  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.88705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1512  methionine aminopeptidase  63.49 
 
 
278 aa  344  8.999999999999999e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1979  methionine aminopeptidase, type I  63.91 
 
 
276 aa  343  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7381  methionine aminopeptidase, type I  60.46 
 
 
274 aa  343  1e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.820359  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0378  methionine aminopeptidase, type I  62.99 
 
 
279 aa  341  7e-93  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0578  methionine aminopeptidase, type I  62.35 
 
 
273 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.37589  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1458  methionine aminopeptidase  63.1 
 
 
279 aa  337  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00203413 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3053  methionine aminopeptidase, type I  61.81 
 
 
275 aa  335  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0172083  normal  0.17574 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0285  methionine aminopeptidase, type I  65.08 
 
 
269 aa  336  2.9999999999999997e-91  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.684295 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6761  methionine aminopeptidase, type I  61.11 
 
 
274 aa  333  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0332677  normal  0.179612 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1910  methionine aminopeptidase  60 
 
 
275 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.529497  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2271  methionine aminopeptidase  60.71 
 
 
278 aa  332  5e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1282  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
275 aa  331  9e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00202985  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7508  methionine aminopeptidase, type I  60.71 
 
 
274 aa  330  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0586  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
275 aa  330  2e-89  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.487821  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1245  methionine aminopeptidase  59.61 
 
 
299 aa  329  2e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.12762  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0829  methionine aminopeptidase  61.73 
 
 
276 aa  325  4.0000000000000003e-88  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0450293  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2206  methionine aminopeptidase, type I  61.9 
 
 
284 aa  325  5e-88  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.462333  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2162  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
279 aa  325  6e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2482  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
284 aa  323  2e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1864  methionine aminopeptidase, type I  62.6 
 
 
255 aa  323  2e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120485  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0078  methionine aminopeptidase  62 
 
 
259 aa  322  4e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0091  methionine aminopeptidase  61.6 
 
 
259 aa  321  6e-87  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.781027  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1273  methionine aminopeptidase  61.2 
 
 
258 aa  321  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.65111  normal  0.766609 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1467  methionine aminopeptidase, type I  61.51 
 
 
284 aa  318  7e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.452473  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0856  methionine aminopeptidase  57.98 
 
 
266 aa  316  2e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2644  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
272 aa  315  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3195  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
273 aa  315  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.218576  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1618  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
272 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2557  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
272 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1393  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
272 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2119  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
272 aa  315  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2504  methionine aminopeptidase, type I  59.45 
 
 
272 aa  315  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.738612  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01139  methionine aminopeptidase  61.04 
 
 
258 aa  315  5e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.133671  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1064  methionine aminopeptidase  58.37 
 
 
266 aa  314  9.999999999999999e-85  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.225405  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1973  methionine aminopeptidase, type I  59.52 
 
 
275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.20175  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1498  methionine aminopeptidase, type I  60.98 
 
 
261 aa  312  3.9999999999999997e-84  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0167  methionine aminopeptidase  59.14 
 
 
260 aa  311  6.999999999999999e-84  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1158  methionine aminopeptidase  58.54 
 
 
258 aa  308  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3245  methionine aminopeptidase, type I  58.57 
 
 
263 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292352  normal  0.873064 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1531  methionine aminopeptidase  58.96 
 
 
267 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000731877  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5037  methionine aminopeptidase, type I  59.61 
 
 
268 aa  306  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.102807  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0106  methionine aminopeptidase, type I  56.3 
 
 
265 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5754  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 
270 aa  305  5.0000000000000004e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.10445  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2146  methionine aminopeptidase, type I  56.81 
 
 
260 aa  305  6e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.236995  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0653  methionine aminopeptidase, type I  57.25 
 
 
261 aa  305  7e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223082  normal  0.529319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1917  methionine aminopeptidase, type I  59.29 
 
 
267 aa  304  9.000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0748746 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1052  methionine aminopeptidase, type I  57.14 
 
 
261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3427  methionine aminopeptidase, type I  56.47 
 
 
261 aa  302  3.0000000000000004e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1590  methionine aminopeptidase  59.35 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.128295  normal  0.424057 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1100  methionine aminopeptidase  59.35 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.479841  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4083  methionine aminopeptidase  59.35 
 
 
260 aa  301  7.000000000000001e-81  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.600561 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1533  methionine aminopeptidase, type I  58.94 
 
 
260 aa  301  8.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1044  methionine aminopeptidase, type I  56.92 
 
 
269 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0010388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4187  methionine aminopeptidase  59.35 
 
 
260 aa  300  1e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.896939  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0925  methionine aminopeptidase, type I  56.92 
 
 
269 aa  300  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0337  methionine aminopeptidase, type I  58.04 
 
 
262 aa  300  1e-80  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.184617  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4816  methionine aminopeptidase, type I  58.43 
 
 
263 aa  299  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1125  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
268 aa  300  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.000764219  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1342  methionine aminopeptidase  58.54 
 
 
260 aa  300  2e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.837163  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1145  methionine aminopeptidase  59.35 
 
 
260 aa  299  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0670  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
268 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1149  methionine aminopeptidase, type I  58.87 
 
 
268 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2485  peptidase M24A  56.64 
 
 
274 aa  297  1e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0113511  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2156  methionine aminopeptidase, type I  56.54 
 
 
268 aa  297  1e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0942578  normal  0.307314 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2549  methionine aminopeptidase, type I  55.65 
 
 
256 aa  296  2e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.461285  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0784  methionine aminopeptidase  56.92 
 
 
269 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.214544 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1548  methionine aminopeptidase, type I  56.28 
 
 
258 aa  296  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0605  methionine aminopeptidase  56.28 
 
 
270 aa  295  5e-79  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.26922  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4261  methionine aminopeptidase, type I  57.26 
 
 
268 aa  295  5e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814393  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2632  methionine aminopeptidase  57.71 
 
 
266 aa  295  5e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.353873  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1027  methionine aminopeptidase, type I  56.45 
 
 
268 aa  294  8e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1031  methionine aminopeptidase, type I  56.85 
 
 
268 aa  295  8e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.872831  normal  0.941111 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17050  methionine aminopeptidase  55.28 
 
 
261 aa  294  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1482  methionine aminopeptidase  55.28 
 
 
261 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0807  peptidase M24A  57.03 
 
 
255 aa  293  2e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0300865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0852  methionine aminopeptidase, type I  58.4 
 
 
263 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01371  methionine aminopeptidase; contains a divalent metal, usually cobalt  56.28 
 
 
264 aa  292  5e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000190504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>