282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2533 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_2533  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 120 aa  231  2.0000000000000002e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2140  ArsR family transcriptional regulator  64.55 
 
 		 117 aa  146  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5578  ArsR family transcriptional regulator  64.71 
 
 		 111 aa  140  6e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.151543 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0619  ArsR family transcriptional regulator  65.69 
 
 		 113 aa  139  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4074  transcriptional regulator, ArsR family  57.89 
 
 		 118 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00570943  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0101  regulatory protein ArsR  67.33 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2244  ArsR family transcriptional regulator  65.38 
 
 		 110 aa  136  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.908668  normal  0.556973 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4198  ArsR family transcriptional regulator  62.04 
 
 		 124 aa  135  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5057  regulatory protein ArsR  65 
 
 		 116 aa  134  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 291 aa  128  3e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1466  ArsR family transcriptional regulator  53.57 
 
 		 129 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0952  ArsR family transcriptional regulator  54.63 
 
 		 124 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2403  ArsR family transcriptional regulator  57.69 
 
 		 109 aa  126  1.0000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656384  normal  0.0239718 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1970  ArsR family transcriptional regulator ArsR1  59.82 
 
 		 127 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.180963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0326  ArsR family transcriptional regulator  58.77 
 
 		 123 aa  124  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3420  regulatory protein, ArsR  60.53 
 
 		 131 aa  124  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4425  ArsR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 155 aa  122  2e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2246  ArsR family transcriptional regulator  63.22 
 
 		 115 aa  118  3e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.362013  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1641  protein tyrosine phosphatase  52.04 
 
 		 309 aa  103  9e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5721  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  103  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3125  ArsR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 110 aa  99.8  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2099  ArsR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 110 aa  100  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.321507  normal  0.577048 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1788  ArsR family transcriptional regulator  49.55 
 
 		 123 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0212653 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2541  ArsR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 117 aa  99  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6064  transcriptional regulator ArsR family  49.04 
 
 		 123 aa  97.8  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3855  regulatory protein, ArsR  51.85 
 
 		 110 aa  97.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  57.61 
 
 		 114 aa  97.4  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2414  transcriptional regulator, ArsR family  49.04 
 
 		 118 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.203968 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3201  regulatory protein ArsR  47.66 
 
 		 119 aa  96.7  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0522  ArsR family transcriptional regulator  52.04 
 
 		 119 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00226567 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3123  ArsR family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 120 aa  95.1  3e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.550975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5705  ArsR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0927566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1046  putative transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 119 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5675  ArsR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.69545  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1388  ArsR family transcriptional regulator  51.09 
 
 		 113 aa  92.4  2e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0697  transcriptional regulator, ArsR family  48.11 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.729608 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3136  regulatory protein, ArsR  50 
 
 		 119 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.651925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3342  regulatory protein, ArsR  46.85 
 
 		 120 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2730  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.636967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1388  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.434154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6167  ArsR family transcriptional regulator  44.25 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.235116 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1406  regulatory protein, ArsR  51.04 
 
 		 110 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.1545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2035  ArsR family transcriptional regulator  46.08 
 
 		 123 aa  88.2  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 114 aa  87.4  5e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  50 
 
 		 120 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1378  ArsR family transcriptional regulator  47.52 
 
 		 118 aa  87  7e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0219707 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6561  ArsR family transcriptional regulator  49.47 
 
 		 111 aa  87  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  47.87 
 
 		 298 aa  87  9e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4966  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0602085  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3194  ArsR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4216  ArsR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 115 aa  85.5  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0911  arsenical resistance transcriptional regulator  45.1 
 
 		 123 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5601  ArsR family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 111 aa  85.5  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0560  arsenical resistance transcriptional regulator  46 
 
 		 111 aa  85.1  3e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0253311  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0961  arsenical resistance transcriptional regulator  46.67 
 
 		 111 aa  84.7  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0333  ArsR family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 109 aa  84.3  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.513803 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0526  ArsR family transcriptional regulator  42.72 
 
 		 276 aa  84.3  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.107472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5681  putative transcriptional regulator, ArsR family  49.07 
 
 		 119 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.825179  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2811  regulatory protein, ArsR  52.63 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0166  regulatory protein, ArsR  45.63 
 
 		 113 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.698937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0217  regulatory protein, ArsR  44.44 
 
 		 120 aa  84.3  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0454  arsenical resistance transcriptional regulator  44.76 
 
 		 244 aa  83.6  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.17354  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1940  ArsR family transcriptional regulator  44.76 
 
 		 227 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.714922  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2159  transcriptional regulator, ArsR family  47.25 
 
 		 131 aa  83.6  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.679753  normal  0.522465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  48 
 
 		 107 aa  82.8  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2480  transcriptional regulator, ArsR family  50.55 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4893  regulatory protein ArsR  47.12 
 
 		 121 aa  82.8  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2859  transcriptional regulator, ArsR  50.55 
 
 		 118 aa  83.2  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.156895  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1486  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 108 aa  82  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.586403  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  46.46 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6330  ArsR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0761907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  39.8 
 
 		 117 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  47.67 
 
 		 110 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5676  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 142 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.225709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30700  Regulatory protein, ArsR family  45.54 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.263428  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05830  transcriptional regulator, ArsR family  40.7 
 
 		 92 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.16233  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2841  ArsR family transcriptional regulator  45.74 
 
 		 110 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.268381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0874  regulatory protein ArsR  47.32 
 
 		 119 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5376  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.563741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4173  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.12 
 
 		 119 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00372298  normal  0.543364 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3864  regulatory protein ArsR  46.15 
 
 		 119 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.325648 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0654  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.67 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.153505 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0487  ArsR family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 115 aa  76.3  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  44.09 
 
 		 106 aa  76.6  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  48.24 
 
 		 105 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  40.21 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2347  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 		 109 aa  75.5  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  40.91 
 
 		 270 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4055  putative transcriptional regulator, ArsR family  45.65 
 
 		 119 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.77885 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1346  putative transcriptional regulator, ArsR family  47.13 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.123906  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3667  ArsR family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2514  ArsR family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 127 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0122169 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  38.78 
 
 		 118 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1138  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2830  putative transcriptional regulator, ArsR family  43.33 
 
 		 108 aa  73.9  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 270 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  46.24 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2318  ArsR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 114 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.136085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1979  transcriptional regulator, ArsR family  43.16 
 
 		 104 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.40138  normal  0.199004 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 		 108 aa  72  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>