27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2230 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2230  hypothetical protein  100 
 
 
217 aa  429  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0435  putative phage repressor  50.85 
 
 
214 aa  155  3e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0734  putative phage repressor  43.55 
 
 
223 aa  143  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.179143  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  41.67 
 
 
208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0863  putative phage repressor  39.44 
 
 
210 aa  138  7e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.767338  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3256  peptidase S24/S26 domain-containing protein  41.59 
 
 
209 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.515672  normal  0.0963352 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  41.11 
 
 
210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  41.11 
 
 
210 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  47.1 
 
 
214 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0516  putative phage repressor  43.82 
 
 
208 aa  132  5e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.431042 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4030  putative phage repressor  40.78 
 
 
217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0549  putative phage repressor  42.17 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.296797  normal  0.036934 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0583  bacteriophage repressor protein  40.86 
 
 
224 aa  129  3e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  40.66 
 
 
210 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0133  putative phage repressor  41.48 
 
 
219 aa  126  3e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.149707  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  38.74 
 
 
225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.78 
 
 
210 aa  124  1e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  39.78 
 
 
210 aa  124  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4624  putative phage repressor  41.57 
 
 
210 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0786  putative phage repressor  42.17 
 
 
210 aa  121  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.775153 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4537  peptidase S24/S26 domain-containing protein  43.64 
 
 
209 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0743  S24 family peptidase  41.67 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0792  S24 family peptidase  41.67 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.597552  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0139  putative phage repressor  42.04 
 
 
215 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.378141 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0218  putative phage repressor  40.96 
 
 
225 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.528514  normal  0.247085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0189  putative phage repressor  40.43 
 
 
225 aa  100  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0191  hypothetical protein  22.94 
 
 
215 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>