48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1812 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1812  hypothetical protein  100 
 
 		 379 aa  779    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.21 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1770  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.25 
 
 		 378 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.217224 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1492  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.65 
 
 		 374 aa  145  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0925306  normal  0.0420453 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0382  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.98 
 
 		 844 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.97387  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1493  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  30.6 
 
 		 630 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.21852  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4330  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.05 
 
 		 487 aa  106  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1814  hypothetical protein  28.96 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.506376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1205  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.18 
 
 		 338 aa  94  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0430708  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4250  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.4 
 
 		 398 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.305989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  26.32 
 
 		 979 aa  72.8  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6689  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.53 
 
 		 391 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5460  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.65 
 
 		 365 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1287  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.64 
 
 		 493 aa  66.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3122  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  27 
 
 		 595 aa  65.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.043835 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0854  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0933972  normal  0.113997 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0253  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.06 
 
 		 368 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0270966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3136  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  21.79 
 
 		 386 aa  63.2  0.000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5188  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.49 
 
 		 423 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  27.02 
 
 		 3172 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  27.02 
 
 		 3301 aa  61.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3778  hypothetical protein  25.81 
 
 		 367 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1193  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  25.09 
 
 		 505 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4960  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.09 
 
 		 399 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0626  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  26.09 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1593  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  36.36 
 
 		 409 aa  52.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4060  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  22.41 
 
 		 375 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2424  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  23.35 
 
 		 360 aa  51.2  0.00003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.47686  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3662  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  25.76 
 
 		 381 aa  50.8  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.849318 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1189  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.31 
 
 		 630 aa  50.4  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.099685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01531  hypothetical protein  20.72 
 
 		 380 aa  50.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5189  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.19 
 
 		 423 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.483793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0099  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  31.51 
 
 		 351 aa  50.1  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3663  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  22.12 
 
 		 398 aa  48.5  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.87959 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00975  hypothetical protein  25.1 
 
 		 378 aa  48.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.480746  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2006  hypothetical protein  28.89 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0161  hypothetical protein  25 
 
 		 349 aa  47.4  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3098  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  24.38 
 
 		 418 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3849  hypothetical protein  35.71 
 
 		 509 aa  46.2  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430064 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2182  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like  31.76 
 
 		 451 aa  46.2  0.0009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.400762  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4387  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  28.97 
 
 		 440 aa  45.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.329255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2023  hypothetical protein  26.04 
 
 		 374 aa  46.2  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.426657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4830  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.51 
 
 		 426 aa  44.7  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal  0.375609 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2266  tetratricopeptide TPR_2  29.73 
 
 		 1213 aa  43.5  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2949  Capsular polysaccharide biosynthesis protein- like protein  22.83 
 
 		 384 aa  43.5  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3001  hypothetical protein  28.3 
 
 		 521 aa  43.1  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489823 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3856  capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  35.14 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.347338 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4404  Capsular polysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.17 
 
 		 456 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.935643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>