96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3351 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  100 
 
 		 166 aa  319  9.999999999999999e-87  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  60.69 
 
 		 155 aa  172  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  54.07 
 
 		 158 aa  171  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  54.73 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  54.73 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  54.73 
 
 		 152 aa  156  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  58.4 
 
 		 182 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  51.22 
 
 		 161 aa  144  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  59.23 
 
 		 167 aa  143  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  49.06 
 
 		 166 aa  141  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  54.35 
 
 		 168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  54.93 
 
 		 159 aa  136  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  60.87 
 
 		 165 aa  134  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  53.28 
 
 		 165 aa  128  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  61 
 
 		 120 aa  127  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  58.82 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  56.35 
 
 		 155 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  55.46 
 
 		 149 aa  122  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  42.38 
 
 		 162 aa  115  1.9999999999999998e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  46.51 
 
 		 145 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  47.86 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  47.33 
 
 		 178 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  48.7 
 
 		 153 aa  101  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  47.79 
 
 		 155 aa  97.4  8e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  45.87 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  45.05 
 
 		 130 aa  88.6  3e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  42.34 
 
 		 132 aa  87  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  42.06 
 
 		 137 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  43.36 
 
 		 133 aa  82.8  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  37.31 
 
 		 134 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  36.36 
 
 		 135 aa  80.1  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  37.93 
 
 		 138 aa  79.7  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  36.75 
 
 		 127 aa  78.2  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  41.44 
 
 		 132 aa  78.2  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  37.17 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  37.17 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  39.09 
 
 		 166 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  38.26 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  38.84 
 
 		 137 aa  74.3  0.0000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  40.54 
 
 		 189 aa  72  0.000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  34.86 
 
 		 126 aa  67  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  37.72 
 
 		 132 aa  67  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  37.63 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  34.68 
 
 		 131 aa  63.5  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  49.15 
 
 		 128 aa  60.5  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  35.4 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  39.08 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  34.55 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  37.93 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  30.51 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  27.27 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  27.27 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  34.69 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  36.79 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  32.48 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  36.72 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  35.92 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  31.19 
 
 		 119 aa  54.7  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  29.71 
 
 		 175 aa  54.7  0.0000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  34.65 
 
 		 185 aa  54.7  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  28.29 
 
 		 170 aa  53.9  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  30.28 
 
 		 148 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  33.03 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  31.3 
 
 		 118 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  31.62 
 
 		 124 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  25.64 
 
 		 120 aa  51.2  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  29.36 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  39.45 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  30.3 
 
 		 168 aa  48.5  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  28.95 
 
 		 142 aa  48.1  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  29.13 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  32.71 
 
 		 162 aa  47  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6131  hypothetical protein  35.71 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271447  normal  0.333617 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  31.53 
 
 		 150 aa  47.4  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  30.51 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1040  protein of unknown function DUF322  29.46 
 
 		 148 aa  46.6  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000237836  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  37.07 
 
 		 130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  30.28 
 
 		 116 aa  45.8  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2540  protein of unknown function DUF322  34.55 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  28.32 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  28.32 
 
 		 115 aa  44.3  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  31.53 
 
 		 119 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  30 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1239  hypothetical protein  34.34 
 
 		 191 aa  41.2  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  27.93 
 
 		 120 aa  40.8  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0758  hypothetical protein  30.77 
 
 		 120 aa  40.8  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  27.93 
 
 		 120 aa  40.8  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>