62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1135 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  100 
 
 
183 aa  355  2.9999999999999997e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  65.81 
 
 
180 aa  184  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  48.24 
 
 
189 aa  156  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  50.29 
 
 
185 aa  150  8e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  55.1 
 
 
168 aa  143  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  48.03 
 
 
175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  39.47 
 
 
166 aa  90.1  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  37.82 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  37.82 
 
 
169 aa  89.4  3e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  37.4 
 
 
134 aa  75.5  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  37.8 
 
 
166 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  38.21 
 
 
145 aa  70.9  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  35.77 
 
 
149 aa  70.5  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  37.93 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  34.07 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  37.7 
 
 
167 aa  67  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  40 
 
 
159 aa  66.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  34.58 
 
 
170 aa  67  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  42.11 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  37.93 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  36.44 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  33.86 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  38.05 
 
 
182 aa  63.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  33.62 
 
 
165 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  38.61 
 
 
132 aa  62  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  35.14 
 
 
132 aa  61.6  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  39.8 
 
 
120 aa  61.2  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  31.54 
 
 
134 aa  60.1  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  37.38 
 
 
137 aa  59.3  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  37.14 
 
 
158 aa  58.5  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  35.78 
 
 
133 aa  58.2  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  35.78 
 
 
155 aa  57.8  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  32.54 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  32.54 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  32.54 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  35.64 
 
 
130 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  30.84 
 
 
153 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  37.17 
 
 
161 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  40 
 
 
128 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  38.1 
 
 
155 aa  55.5  0.0000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  35.92 
 
 
166 aa  55.1  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  33.03 
 
 
168 aa  54.7  0.0000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  36.89 
 
 
164 aa  54.3  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  47.3 
 
 
155 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  30.84 
 
 
153 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  41.27 
 
 
132 aa  52.4  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  41.94 
 
 
161 aa  52  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  47.46 
 
 
137 aa  51.6  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  28.83 
 
 
145 aa  50.4  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  39.39 
 
 
160 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  34.04 
 
 
119 aa  46.6  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  31.78 
 
 
130 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  29.73 
 
 
126 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  29.73 
 
 
201 aa  44.3  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  27.68 
 
 
162 aa  44.3  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  26.42 
 
 
119 aa  43.5  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  31.31 
 
 
138 aa  42  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  29.41 
 
 
124 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1473  protein of unknown function DUF322  43.48 
 
 
122 aa  41.2  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>