62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1598 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  100 
 
 		 161 aa  289  9e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  38.71 
 
 		 166 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  43.75 
 
 		 168 aa  79.3  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  41.74 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  38.41 
 
 		 161 aa  78.6  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  42.31 
 
 		 155 aa  77.8  0.00000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  38.65 
 
 		 165 aa  77  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  36.88 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  36.88 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  36.88 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  40 
 
 		 159 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  43.36 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  46.55 
 
 		 160 aa  75.1  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  37.3 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  39.71 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  40.91 
 
 		 153 aa  72  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  39.45 
 
 		 162 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  36.3 
 
 		 167 aa  71.2  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  36.89 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  39.09 
 
 		 158 aa  70.9  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  34.26 
 
 		 189 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  39.17 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  38.06 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  39.8 
 
 		 120 aa  64.3  0.0000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  37.3 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  36.45 
 
 		 130 aa  62  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  36.04 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  34.86 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  33.64 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  32.17 
 
 		 183 aa  57.4  0.00000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  34.51 
 
 		 164 aa  57.4  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  33.94 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  34.65 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  28.93 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  33.94 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  34.45 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  30.16 
 
 		 134 aa  53.9  0.0000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  31.25 
 
 		 185 aa  53.5  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  52  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  28.97 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  40.68 
 
 		 128 aa  50.1  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  37.38 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  33.04 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  31.3 
 
 		 166 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  28.32 
 
 		 138 aa  48.1  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  27.33 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  27.33 
 
 		 169 aa  47.8  0.00006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  35.09 
 
 		 132 aa  47.4  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  28.04 
 
 		 119 aa  47  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  34.48 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  31.86 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  33.93 
 
 		 201 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  33.01 
 
 		 168 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  27.1 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  27.1 
 
 		 115 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  30.58 
 
 		 124 aa  44.7  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  39.13 
 
 		 137 aa  42.4  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  30.58 
 
 		 160 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  29.52 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  26.92 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  30.91 
 
 		 133 aa  40.4  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>