116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4681 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  100 
 
 
155 aa  303  7e-82  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  71.32 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  62.77 
 
 
168 aa  166  8e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  60.26 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  60.26 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  60.26 
 
 
152 aa  164  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  63.77 
 
 
167 aa  162  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  52.76 
 
 
161 aa  161  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  57.45 
 
 
182 aa  160  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  55.06 
 
 
158 aa  150  8.999999999999999e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  64.1 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  55.56 
 
 
159 aa  144  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  54.19 
 
 
155 aa  145  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  65.69 
 
 
120 aa  143  1e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  56.35 
 
 
166 aa  140  6e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  55.64 
 
 
162 aa  139  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  67.77 
 
 
160 aa  138  3e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  60.17 
 
 
165 aa  135  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  56.91 
 
 
149 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  55.04 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  53.03 
 
 
178 aa  129  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  49.21 
 
 
164 aa  123  1e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  52.94 
 
 
155 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  49.11 
 
 
153 aa  100  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  46.15 
 
 
153 aa  98.6  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  40.65 
 
 
135 aa  91.7  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  41.38 
 
 
132 aa  89.4  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  45.9 
 
 
137 aa  88.6  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  41.35 
 
 
130 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  44 
 
 
137 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  46.73 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  46.73 
 
 
169 aa  86.7  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  47.66 
 
 
166 aa  84.3  6e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  47.01 
 
 
133 aa  82.4  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  39.47 
 
 
127 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  36.15 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  38.35 
 
 
189 aa  78.6  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  38.17 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  38.4 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  42.31 
 
 
161 aa  72.8  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  36.27 
 
 
150 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  37.98 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  42.24 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  38.78 
 
 
185 aa  67  0.00000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  39.82 
 
 
201 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  39.8 
 
 
168 aa  66.2  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  32.11 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  31.34 
 
 
175 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  31.78 
 
 
127 aa  66.2  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  36.44 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  33.07 
 
 
180 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  50.85 
 
 
128 aa  62  0.000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  32.56 
 
 
133 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  30.89 
 
 
124 aa  60.5  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  27.45 
 
 
170 aa  60.5  0.000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
131 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  37.04 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6131  hypothetical protein  41.94 
 
 
192 aa  58.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271447  normal  0.333617 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  28.33 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  28.33 
 
 
129 aa  55.1  0.0000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  30.09 
 
 
119 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  28.91 
 
 
145 aa  53.9  0.0000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  32.11 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  34.92 
 
 
162 aa  52.8  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  28.45 
 
 
116 aa  52  0.000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  31.19 
 
 
150 aa  51.6  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  36.89 
 
 
148 aa  51.6  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
118 aa  50.8  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  37.29 
 
 
237 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  27.52 
 
 
148 aa  48.9  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4997  hypothetical protein  33.62 
 
 
134 aa  48.5  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  32.11 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  32.11 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  29.46 
 
 
118 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1089  hypothetical protein  25 
 
 
114 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  35.45 
 
 
140 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  32.46 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  24.59 
 
 
144 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  31.13 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  32.2 
 
 
124 aa  45.4  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  26.67 
 
 
139 aa  45.1  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  32.86 
 
 
142 aa  44.7  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  27.05 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1040  protein of unknown function DUF322  32.17 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0758  hypothetical protein  32.77 
 
 
120 aa  44.3  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  29.2 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  28.95 
 
 
120 aa  43.9  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  26.27 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2070  hypothetical protein  26.92 
 
 
285 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>