135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2516 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  254  2e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  49.06 
 
 		 134 aa  110  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  48.28 
 
 		 137 aa  107  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  50 
 
 		 134 aa  107  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  47.83 
 
 		 135 aa  107  6e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  51.96 
 
 		 132 aa  105  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  40.5 
 
 		 131 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  53.77 
 
 		 132 aa  103  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  47.06 
 
 		 127 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  42.98 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  47.79 
 
 		 130 aa  102  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  47.86 
 
 		 137 aa  99.4  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  44.83 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  41.07 
 
 		 133 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  44.55 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  44.44 
 
 		 130 aa  88.2  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  46.51 
 
 		 128 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  37.39 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  35.71 
 
 		 124 aa  84  7e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  37.14 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  37.89 
 
 		 237 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  36.72 
 
 		 155 aa  76.6  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  39.8 
 
 		 148 aa  75.5  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  38.26 
 
 		 166 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  34.78 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  34.78 
 
 		 129 aa  74.7  0.0000000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  35.04 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  35.07 
 
 		 168 aa  73.9  0.0000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  39.67 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  37.04 
 
 		 159 aa  72.8  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  39.67 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  39.67 
 
 		 152 aa  72.8  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  37.96 
 
 		 119 aa  72.4  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  35.71 
 
 		 158 aa  71.6  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  33.94 
 
 		 149 aa  71.2  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  34.75 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  34.75 
 
 		 169 aa  71.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  38.1 
 
 		 165 aa  70.9  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  34.82 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  34.82 
 
 		 120 aa  70.1  0.00000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  29.2 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  33.03 
 
 		 178 aa  69.7  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  36.73 
 
 		 166 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  33.33 
 
 		 120 aa  69.3  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  35.96 
 
 		 119 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  44.04 
 
 		 140 aa  68.2  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  32.74 
 
 		 118 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1086  hypothetical protein  31.19 
 
 		 120 aa  67  0.00000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  28.91 
 
 		 150 aa  65.9  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  34.4 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  32.41 
 
 		 133 aa  65.5  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  32.86 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  35.77 
 
 		 162 aa  63.9  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  35.85 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  37.96 
 
 		 161 aa  63.9  0.0000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  33.91 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  33.04 
 
 		 120 aa  63.5  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  32.73 
 
 		 116 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1040  protein of unknown function DUF322  35.4 
 
 		 148 aa  62.4  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000237836  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  33.66 
 
 		 127 aa  62.8  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  32.17 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  39.62 
 
 		 165 aa  62.4  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  36.44 
 
 		 166 aa  62.8  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  37.61 
 
 		 160 aa  60.8  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  33.91 
 
 		 164 aa  61.2  0.000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  28.57 
 
 		 121 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  31.82 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  32.41 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  30.43 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  36.44 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  29.46 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  28.83 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  26.72 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  31.58 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  35.51 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  32.43 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  31.03 
 
 		 124 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  31.19 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  32.43 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  32.43 
 
 		 115 aa  57.4  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  39.78 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1743  hypothetical protein  29.57 
 
 		 116 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>