102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_0749 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  100 
 
 
148 aa  294  3e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  42.86 
 
 
145 aa  113  8.999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  39.25 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  39.66 
 
 
150 aa  94  6e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  35.65 
 
 
131 aa  93.2  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  42.45 
 
 
130 aa  92  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  39.02 
 
 
129 aa  84  6e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  37.39 
 
 
133 aa  84  7e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  34.71 
 
 
137 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  37.5 
 
 
135 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  34.48 
 
 
134 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  38.71 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  37.82 
 
 
129 aa  75.5  0.0000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  40.57 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  33.61 
 
 
133 aa  75.9  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  32.14 
 
 
127 aa  72.8  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  34.38 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  36.08 
 
 
132 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  31.78 
 
 
137 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  28.97 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  28.97 
 
 
129 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  31.5 
 
 
130 aa  63.9  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
128 aa  63.9  0.0000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  35.42 
 
 
132 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  28.95 
 
 
159 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  26.72 
 
 
130 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  27.59 
 
 
124 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1239  hypothetical protein  32.09 
 
 
191 aa  57  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  32.69 
 
 
116 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  33.33 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  33.33 
 
 
169 aa  56.6  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  29.46 
 
 
165 aa  56.2  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  29.46 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  29.46 
 
 
120 aa  55.5  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  31.48 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  31.19 
 
 
168 aa  54.7  0.0000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  29.75 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  29.75 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  29.75 
 
 
152 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1086  hypothetical protein  29.29 
 
 
120 aa  53.9  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1721  hypothetical protein  30.21 
 
 
110 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101939  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  30.97 
 
 
155 aa  53.9  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  29 
 
 
167 aa  53.9  0.0000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  30.28 
 
 
166 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  29.2 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  28.57 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  28.32 
 
 
158 aa  50.8  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  26.8 
 
 
149 aa  50.4  0.000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  29.63 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  33.94 
 
 
237 aa  49.7  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  29.29 
 
 
120 aa  49.7  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  30.56 
 
 
164 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  26.8 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  31.34 
 
 
118 aa  47.8  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2540  protein of unknown function DUF322  25.51 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  29.58 
 
 
142 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  28.87 
 
 
119 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  30.61 
 
 
120 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  26.32 
 
 
121 aa  45.8  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  28.04 
 
 
118 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09980  hypothetical protein  32.99 
 
 
115 aa  46.2  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000012497  hitchhiker  0.00000206234 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  29.06 
 
 
127 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  27.78 
 
 
145 aa  45.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  23.89 
 
 
144 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  27.55 
 
 
124 aa  44.3  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  27.96 
 
 
116 aa  44.7  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  24.49 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  26.32 
 
 
162 aa  43.9  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0791  hypothetical protein  27.97 
 
 
124 aa  43.9  0.0008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.967276  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  26.32 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2996  protein of unknown function DUF322  24.68 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  27.55 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  27.87 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  26.6 
 
 
120 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  31.82 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2786  hypothetical protein  25.97 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116147  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1059  hypothetical protein  34.15 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214428  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1284  hypothetical protein  25.66 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132839  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  28.43 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1309  hypothetical protein  25.66 
 
 
124 aa  42.7  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108865  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  28.57 
 
 
120 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1053  hypothetical protein  34.15 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  28.71 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  25.53 
 
 
189 aa  42  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  26.17 
 
 
175 aa  41.6  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  29.7 
 
 
182 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  27.55 
 
 
120 aa  42  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  27.78 
 
 
155 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  27.36 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1089  hypothetical protein  24.24 
 
 
114 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>