100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1704 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  226  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  50.89 
 
 		 119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  45.54 
 
 		 120 aa  112  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1222  protein of unknown function DUF322  45.54 
 
 		 116 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  42.34 
 
 		 118 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  43.64 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  42.61 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3680  hypothetical protein  42.73 
 
 		 120 aa  96.3  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000589805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2509  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  96.7  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000137615  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3616  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000485784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3871  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.27475e-32 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1287  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000400047  hitchhiker  0.00000103089 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3956  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000150921  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3598  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.6047e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3905  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000704337  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3708  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000339782  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3899  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000032718  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3995  hypothetical protein  41.82 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000107112  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0758  hypothetical protein  42.34 
 
 		 120 aa  95.5  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  43.75 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  43.93 
 
 		 118 aa  94  6e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1284  hypothetical protein  41.07 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132839  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1309  hypothetical protein  41.07 
 
 		 124 aa  92.4  2e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108865  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1743  hypothetical protein  40 
 
 		 116 aa  92.4  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000509251  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0791  hypothetical protein  39.29 
 
 		 124 aa  87.8  5e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.967276  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05570  hypothetical protein  33.64 
 
 		 115 aa  87  8e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.579477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  33.04 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  41.67 
 
 		 124 aa  85.1  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  35.85 
 
 		 116 aa  84.7  4e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0130  hypothetical protein  40.74 
 
 		 121 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000409279  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1041  protein of unknown function DUF322  37.17 
 
 		 117 aa  83.6  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0582694  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  39.81 
 
 		 121 aa  82.4  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  38.18 
 
 		 120 aa  80.9  0.000000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  36.28 
 
 		 134 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09980  hypothetical protein  30.84 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000012497  hitchhiker  0.00000206234 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  36.45 
 
 		 120 aa  77.8  0.00000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0366  hypothetical protein  30.63 
 
 		 158 aa  77  0.00000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000405379  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1352  protein of unknown function DUF322  33.64 
 
 		 115 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000887072  normal  0.246118 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  37.96 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  36.7 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  39.62 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  35.51 
 
 		 127 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  35.45 
 
 		 134 aa  72  0.000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0862  protein of unknown function DUF322  28.3 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000204946  normal  0.791089 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  33.64 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 		 124 aa  63.9  0.0000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  34.91 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  35.78 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  34.26 
 
 		 132 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1721  hypothetical protein  28.3 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.101939  normal  0.130131 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  35.71 
 
 		 124 aa  57.8  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  32.41 
 
 		 132 aa  57.4  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  32.43 
 
 		 130 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1053  hypothetical protein  33.94 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1059  hypothetical protein  33.94 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000214428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  38.37 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0251  hypothetical protein  33.64 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  36.36 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  36.36 
 
 		 148 aa  54.3  0.0000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  28.97 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  28.43 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  31 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  30.48 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  30.48 
 
 		 129 aa  52.8  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  27.45 
 
 		 131 aa  52.8  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  32.38 
 
 		 140 aa  50.8  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  32.14 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  27.93 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  27.93 
 
 		 120 aa  50.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  31.43 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  31.13 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  29.82 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  32.11 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1086  hypothetical protein  25.71 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  27.52 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  27.52 
 
 		 178 aa  47  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1516  hypothetical protein  26.79 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  29.31 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  29.91 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  28.7 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1040  protein of unknown function DUF322  29.57 
 
 		 148 aa  46.2  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000237836  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  28.7 
 
 		 159 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1089  hypothetical protein  28.44 
 
 		 114 aa  45.1  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  28.21 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  31.86 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  28.32 
 
 		 166 aa  44.3  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  28.32 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  30.36 
 
 		 167 aa  43.9  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05240  hypothetical protein  25.96 
 
 		 115 aa  43.9  0.0008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  26.72 
 
 		 168 aa  42  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  26.72 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  26.72 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  26.72 
 
 		 152 aa  41.6  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1052  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1060  hypothetical protein  29.36 
 
 		 121 aa  41.2  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2996  protein of unknown function DUF322  29.52 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2786  hypothetical protein  27.62 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0116147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  27.52 
 
 		 161 aa  40.4  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  24.53 
 
 		 129 aa  40.4  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>