93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0774 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  100 
 
 
182 aa  355  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  73.61 
 
 
161 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  65.62 
 
 
166 aa  157  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  58.52 
 
 
152 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  58.52 
 
 
152 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  58.52 
 
 
152 aa  153  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  59.12 
 
 
162 aa  150  8e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  58.4 
 
 
166 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  54.42 
 
 
158 aa  148  5e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  56.55 
 
 
167 aa  147  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  58.96 
 
 
168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  57.97 
 
 
155 aa  146  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  60.14 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  59.56 
 
 
165 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  56.83 
 
 
155 aa  137  8.999999999999999e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  62.83 
 
 
159 aa  136  2e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  64 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  53.68 
 
 
149 aa  132  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  59.84 
 
 
160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  50.39 
 
 
145 aa  117  9e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  48.06 
 
 
164 aa  115  3e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  45.74 
 
 
178 aa  102  4e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  47.33 
 
 
155 aa  97.4  9e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  45.95 
 
 
153 aa  95.1  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  44.35 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  37.76 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  37.76 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  36.17 
 
 
166 aa  87  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  40.68 
 
 
130 aa  80.9  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  44.92 
 
 
133 aa  79  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  42.06 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  40.16 
 
 
137 aa  75.9  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  40.54 
 
 
132 aa  75.5  0.0000000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  40.8 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  39.52 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  37.5 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  37.86 
 
 
150 aa  72  0.000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  36.21 
 
 
127 aa  68.9  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  44.83 
 
 
161 aa  67.4  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  39.09 
 
 
201 aa  67  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  34.4 
 
 
138 aa  67  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  40.71 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  34.86 
 
 
189 aa  64.7  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  32.86 
 
 
130 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  35.78 
 
 
168 aa  63.5  0.000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  38.05 
 
 
183 aa  63.5  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  30.83 
 
 
175 aa  61.2  0.000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  36.89 
 
 
185 aa  60.8  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  33.91 
 
 
129 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  35.64 
 
 
180 aa  60.1  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  33.91 
 
 
129 aa  60.1  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  43.75 
 
 
128 aa  58.9  0.00000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  32.46 
 
 
124 aa  58.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  34.92 
 
 
134 aa  58.2  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  29.27 
 
 
127 aa  57  0.0000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  34.82 
 
 
119 aa  56.2  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  42.72 
 
 
148 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  33.03 
 
 
131 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  27.73 
 
 
120 aa  54.3  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  29.92 
 
 
126 aa  52  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  29.31 
 
 
133 aa  51.6  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  31.25 
 
 
130 aa  51.2  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6131  hypothetical protein  36.73 
 
 
192 aa  51.2  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271447  normal  0.333617 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  33.04 
 
 
119 aa  51.2  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  31.93 
 
 
118 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  27.35 
 
 
116 aa  49.7  0.00003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  32.11 
 
 
145 aa  48.9  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  30 
 
 
142 aa  48.5  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  29.66 
 
 
124 aa  47.8  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  30.51 
 
 
120 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  28.57 
 
 
144 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  28.46 
 
 
118 aa  45.1  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2070  hypothetical protein  24.32 
 
 
285 aa  44.3  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2540  protein of unknown function DUF322  31.82 
 
 
115 aa  44.3  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  31.13 
 
 
133 aa  43.5  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  36.36 
 
 
237 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  33.04 
 
 
130 aa  43.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  41.18 
 
 
152 aa  42.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  29.25 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0750  hypothetical protein  26.36 
 
 
116 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000236289  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  29.7 
 
 
148 aa  42  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1963  protein of unknown function DUF322  28.81 
 
 
120 aa  41.2  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  26.79 
 
 
120 aa  40.8  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  26.79 
 
 
120 aa  40.8  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>