67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0407 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  294  3e-79  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  79.22 
 
 
153 aa  218  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  50 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  48.84 
 
 
152 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  48.84 
 
 
152 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  48.84 
 
 
152 aa  112  3e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  48.84 
 
 
168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  47.86 
 
 
158 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  43.97 
 
 
165 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  47.79 
 
 
159 aa  100  8e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  45.97 
 
 
149 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  48.31 
 
 
155 aa  99  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  47.46 
 
 
167 aa  97.1  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  45.87 
 
 
166 aa  96.3  1e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  45.95 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  49.55 
 
 
165 aa  94.7  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  40.16 
 
 
162 aa  94.4  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  43.1 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  43.51 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  40.65 
 
 
166 aa  90.5  7e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  48.28 
 
 
160 aa  83.2  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  46.15 
 
 
155 aa  79  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  42 
 
 
120 aa  79  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  39.32 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  36.7 
 
 
130 aa  69.3  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  35.65 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  38.26 
 
 
155 aa  67.8  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  38.98 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  34.78 
 
 
134 aa  67.8  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  33.64 
 
 
132 aa  65.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  32.5 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  32.5 
 
 
169 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  36.13 
 
 
138 aa  64.3  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  34.78 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  29.55 
 
 
166 aa  63.5  0.0000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  34.06 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  42.11 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  36.44 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  35.09 
 
 
134 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  28.95 
 
 
189 aa  59.3  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  34.33 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  26.56 
 
 
170 aa  57  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  30.36 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  36.11 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  35.19 
 
 
132 aa  53.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  30.84 
 
 
183 aa  53.5  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  28.7 
 
 
175 aa  53.5  0.000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  23.85 
 
 
120 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  30.28 
 
 
119 aa  52.4  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  34.29 
 
 
126 aa  52  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  28.85 
 
 
124 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  32.38 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  27.36 
 
 
150 aa  47.8  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  36.78 
 
 
140 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  28.7 
 
 
131 aa  47.4  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  30.28 
 
 
118 aa  47  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  27.12 
 
 
142 aa  46.6  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  31.9 
 
 
201 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  29.17 
 
 
180 aa  44.7  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4776  hypothetical protein  34.26 
 
 
160 aa  44.3  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  27.35 
 
 
124 aa  43.9  0.0007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  24.37 
 
 
120 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2797  protein of unknown function DUF322  38.14 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.341039  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  26.04 
 
 
185 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  26.5 
 
 
133 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  25.96 
 
 
133 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  27.78 
 
 
168 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>