100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1595 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  100 
 
 
168 aa  324  3e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  57.83 
 
 
152 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  57.83 
 
 
152 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  57.83 
 
 
152 aa  173  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  82.5 
 
 
160 aa  168  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  63.64 
 
 
166 aa  152  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  58.97 
 
 
167 aa  150  8e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  55.92 
 
 
158 aa  149  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  58.96 
 
 
182 aa  146  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  52.83 
 
 
161 aa  146  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  56.08 
 
 
165 aa  143  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  50 
 
 
166 aa  141  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  62.77 
 
 
155 aa  140  7e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  50 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  64.1 
 
 
159 aa  137  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  61.42 
 
 
165 aa  136  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  62.75 
 
 
120 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  51.49 
 
 
162 aa  128  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  50 
 
 
178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  55.83 
 
 
149 aa  120  6e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  50.79 
 
 
164 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  53.73 
 
 
145 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  51.72 
 
 
153 aa  113  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  48.84 
 
 
153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  51.16 
 
 
155 aa  102  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  43.75 
 
 
137 aa  94.4  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  41.6 
 
 
134 aa  87.4  9e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  45.16 
 
 
133 aa  87  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  40.94 
 
 
130 aa  85.9  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  39.5 
 
 
127 aa  86.3  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  39.2 
 
 
135 aa  85.5  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  38.24 
 
 
134 aa  84.3  7e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  40.18 
 
 
132 aa  83.6  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  40.8 
 
 
137 aa  80.5  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  43.4 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  43.4 
 
 
169 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  40.71 
 
 
166 aa  77.4  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  35.07 
 
 
130 aa  73.9  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  39.67 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  42.52 
 
 
132 aa  70.9  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  32.14 
 
 
189 aa  70.5  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  37.84 
 
 
131 aa  66.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  43.96 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  32.74 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  32.43 
 
 
127 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  33.9 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  37.93 
 
 
126 aa  63.2  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  34.21 
 
 
180 aa  60.8  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  32.38 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  28.95 
 
 
124 aa  60.5  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  41.46 
 
 
128 aa  60.1  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  35.78 
 
 
130 aa  58.9  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  27.2 
 
 
175 aa  57  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  32 
 
 
185 aa  57  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  31.5 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  33.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6131  hypothetical protein  42.62 
 
 
192 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.271447  normal  0.333617 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  28.45 
 
 
145 aa  54.7  0.0000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  31.19 
 
 
148 aa  54.7  0.0000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  37.86 
 
 
148 aa  54.3  0.0000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  35.83 
 
 
201 aa  54.3  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  34.15 
 
 
237 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  30.25 
 
 
129 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  30.25 
 
 
129 aa  52.4  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  30.99 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  30.33 
 
 
118 aa  51.6  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  31.62 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  28.33 
 
 
144 aa  50.4  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  36.51 
 
 
140 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  36.7 
 
 
130 aa  48.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  26.09 
 
 
142 aa  47  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  29.36 
 
 
120 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  29.09 
 
 
116 aa  47.4  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  29.66 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  30.19 
 
 
133 aa  45.4  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  26.36 
 
 
170 aa  44.3  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  27.91 
 
 
162 aa  43.9  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1073  protein of unknown function DUF322  28.33 
 
 
120 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.374803  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0750  hypothetical protein  31.86 
 
 
116 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000236289  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1584  hypothetical protein  27.12 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0016601  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1617  hypothetical protein  27.12 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000117464  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  24.14 
 
 
121 aa  42.7  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1164  hypothetical protein  31.93 
 
 
120 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000269961  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  26.72 
 
 
115 aa  42  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  26.72 
 
 
115 aa  42  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  29.82 
 
 
118 aa  42  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2070  hypothetical protein  25.96 
 
 
285 aa  41.6  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  30.36 
 
 
119 aa  41.6  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  33.94 
 
 
152 aa  41.6  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0769  hypothetical protein  25.2 
 
 
120 aa  41.2  0.007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  5.38931e-16  hitchhiker  0.0000000108029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  30.51 
 
 
124 aa  41.2  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>