52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0389 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  100 
 
 		 162 aa  320  5e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  37.86 
 
 		 170 aa  86.3  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  32.2 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  32.46 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  32.46 
 
 		 169 aa  67.8  0.00000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  28.8 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  32.46 
 
 		 127 aa  58.9  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  29.06 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  27.43 
 
 		 189 aa  56.6  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  29.57 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  32.91 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  36.19 
 
 		 130 aa  53.9  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  33.33 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  30.58 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  29.7 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  25.21 
 
 		 139 aa  51.6  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  28.69 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  30.77 
 
 		 164 aa  51.2  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  29.73 
 
 		 185 aa  50.8  0.000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  24.2 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  29 
 
 		 131 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  31.15 
 
 		 161 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  29.79 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  30.25 
 
 		 158 aa  49.3  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  33.91 
 
 		 132 aa  49.7  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2540  protein of unknown function DUF322  26.67 
 
 		 115 aa  48.5  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  30.58 
 
 		 165 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  29.9 
 
 		 134 aa  48.5  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  23.13 
 
 		 175 aa  48.1  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  27.78 
 
 		 132 aa  47.8  0.00006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  33.6 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  32.71 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  32.98 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  31.68 
 
 		 155 aa  47  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  29.73 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  28.87 
 
 		 124 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  30.48 
 
 		 159 aa  44.7  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  27.68 
 
 		 183 aa  44.3  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  27.61 
 
 		 168 aa  43.9  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  30 
 
 		 168 aa  43.1  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  26.27 
 
 		 148 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  30.28 
 
 		 149 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  31.43 
 
 		 165 aa  42  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  31.82 
 
 		 152 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  31.68 
 
 		 133 aa  41.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  26.23 
 
 		 126 aa  41.2  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  30.93 
 
 		 130 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  24.42 
 
 		 128 aa  40.8  0.008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  32.14 
 
 		 166 aa  40.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>