69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1137 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  100 
 
 
180 aa  355  1.9999999999999998e-97  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  65.81 
 
 
183 aa  201  5e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  52.75 
 
 
189 aa  179  2e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  60.24 
 
 
168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  52.57 
 
 
185 aa  163  1.0000000000000001e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  48.78 
 
 
175 aa  149  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  46.85 
 
 
166 aa  102  2e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  42.98 
 
 
169 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  42.98 
 
 
169 aa  97.4  9e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  36.51 
 
 
127 aa  89  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  36.22 
 
 
166 aa  79.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  34.92 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  35.38 
 
 
139 aa  77  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  37.41 
 
 
152 aa  77  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  37.17 
 
 
170 aa  76.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  39.45 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  34.15 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  38.74 
 
 
159 aa  74.7  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  36 
 
 
168 aa  73.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  39.64 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  38.02 
 
 
158 aa  72.4  0.000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  38.32 
 
 
165 aa  72.4  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  38.39 
 
 
182 aa  72.4  0.000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  41.28 
 
 
155 aa  72  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  39.09 
 
 
166 aa  70.9  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  41.84 
 
 
150 aa  68.9  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  35.78 
 
 
149 aa  68.9  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  32.14 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
145 aa  66.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  40 
 
 
120 aa  65.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  31.93 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  35.4 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  32.48 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  36.61 
 
 
160 aa  59.7  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  31.37 
 
 
135 aa  58.9  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  34.62 
 
 
155 aa  58.9  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  33.33 
 
 
162 aa  58.2  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  31.48 
 
 
153 aa  58.2  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  32.35 
 
 
137 aa  57.8  0.00000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  33.33 
 
 
133 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  30.97 
 
 
153 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  36.36 
 
 
155 aa  56.6  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  30.97 
 
 
145 aa  56.2  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  29.52 
 
 
132 aa  55.8  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  29.75 
 
 
130 aa  55.1  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  35.14 
 
 
164 aa  54.7  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  34.12 
 
 
128 aa  53.5  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  29.73 
 
 
162 aa  53.5  0.000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  26.85 
 
 
134 aa  53.1  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  49.09 
 
 
161 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  34.31 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  28.57 
 
 
133 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  28.87 
 
 
148 aa  48.5  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  30.83 
 
 
237 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  32.56 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  30.43 
 
 
201 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  28.71 
 
 
126 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  30.39 
 
 
132 aa  46.2  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  29.41 
 
 
119 aa  45.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  26.96 
 
 
131 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  24.07 
 
 
119 aa  45.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  29.2 
 
 
130 aa  45.8  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  25 
 
 
148 aa  45.1  0.0006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  29.36 
 
 
138 aa  43.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  26.74 
 
 
142 aa  43.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  29.09 
 
 
133 aa  42  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  29.84 
 
 
129 aa  42  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>