88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_27170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  323  5e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  52.71 
 
 		 166 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  50.39 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  51.15 
 
 		 167 aa  117  7.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  46.92 
 
 		 161 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  49.18 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  49.18 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  49.18 
 
 		 152 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  48.06 
 
 		 182 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  49.29 
 
 		 155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  47.15 
 
 		 162 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  50.83 
 
 		 149 aa  112  3e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  49.21 
 
 		 158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  47.86 
 
 		 166 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  49.21 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  44.62 
 
 		 178 aa  104  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  50.83 
 
 		 160 aa  102  3e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  49.12 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  51 
 
 		 120 aa  99.4  2e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  47.15 
 
 		 145 aa  95.1  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  41.74 
 
 		 165 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  39.84 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  45.3 
 
 		 155 aa  83.2  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  39.34 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  39.34 
 
 		 169 aa  78.2  0.00000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  39.32 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  38.94 
 
 		 132 aa  75.9  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  42.06 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  39.52 
 
 		 134 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  36.44 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  35.54 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  38.46 
 
 		 133 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  34.43 
 
 		 137 aa  64.7  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  34.23 
 
 		 127 aa  61.6  0.000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  32.8 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  33.91 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  35.38 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  29.93 
 
 		 189 aa  60.1  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  32.5 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  36.04 
 
 		 132 aa  58.9  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  30.89 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  39.5 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  30.09 
 
 		 120 aa  54.7  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  36.89 
 
 		 183 aa  54.3  0.0000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  33.64 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  29.13 
 
 		 127 aa  52  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3838  protein of unknown function DUF322  32.74 
 
 		 118 aa  51.2  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.55923e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  30.77 
 
 		 162 aa  51.2  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  30.83 
 
 		 131 aa  50.8  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1704  hypothetical protein  32.14 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1986  hypothetical protein  32.14 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  32.74 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  38.46 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  29.32 
 
 		 133 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0197  hypothetical protein  29.57 
 
 		 144 aa  48.5  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000491203  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  48.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0749  hypothetical protein  30.56 
 
 		 148 aa  48.1  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00125864 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  27.01 
 
 		 201 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  28.1 
 
 		 170 aa  48.1  0.00006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  34.07 
 
 		 161 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1855  alkaline-shock protein  29.31 
 
 		 121 aa  47  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000204659  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  26.32 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  31.19 
 
 		 133 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1505  hypothetical protein  30 
 
 		 124 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.453517  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  37.25 
 
 		 148 aa  45.8  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  31.96 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  26.32 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2892  hypothetical protein  31.36 
 
 		 118 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000110692  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  27.73 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  27.73 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  27.36 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0697  hypothetical protein  34.43 
 
 		 152 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0226225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2662  protein of unknown function DUF322  30.65 
 
 		 124 aa  43.1  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000716199  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  28.46 
 
 		 168 aa  42.4  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  23.74 
 
 		 142 aa  42.4  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  33.63 
 
 		 130 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  26.42 
 
 		 139 aa  40.8  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0447  hypothetical protein  26.79 
 
 		 116 aa  40.8  0.009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000128689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>