39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0989 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  100 
 
 
139 aa  271  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  39.37 
 
 
150 aa  87  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  37.61 
 
 
166 aa  85.1  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  36.36 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  36.36 
 
 
169 aa  84.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  30.3 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  29.41 
 
 
170 aa  68.6  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  31.78 
 
 
189 aa  67.4  0.00000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  35.38 
 
 
180 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  33.33 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  29.13 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  34.62 
 
 
168 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  32.73 
 
 
185 aa  57.8  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  28.21 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  26.36 
 
 
126 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  28.7 
 
 
127 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  25.21 
 
 
162 aa  51.6  0.000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  31.4 
 
 
135 aa  50.1  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  27.36 
 
 
150 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  26.72 
 
 
134 aa  47.4  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  29.13 
 
 
166 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  27.52 
 
 
130 aa  45.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1040  protein of unknown function DUF322  29.36 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000000237836  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  26.61 
 
 
178 aa  44.3  0.0005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  25.44 
 
 
124 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  23.36 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2266  protein of unknown function DUF322  26.51 
 
 
140 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  21.43 
 
 
132 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  22.52 
 
 
129 aa  42  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  22.52 
 
 
129 aa  42  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  31.46 
 
 
142 aa  41.6  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  29.27 
 
 
128 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  23.85 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  26.42 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  25 
 
 
155 aa  40.8  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  23.39 
 
 
145 aa  40.8  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  23.91 
 
 
148 aa  40  0.009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  22.02 
 
 
149 aa  40.4  0.009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  23.14 
 
 
167 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>