86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2146 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2146  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  321  4e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00278996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1962  hypothetical protein  63.58 
 
 
185 aa  192  3e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.531599  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0057  hypothetical protein  55.69 
 
 
189 aa  179  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1137  gls24 protein, putative  60.24 
 
 
180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0335052  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0864  hypothetical protein  52.66 
 
 
175 aa  159  1e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0984158  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1135  gls24 protein, putative  55.1 
 
 
183 aa  157  8e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0111706  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1782  alkaline shock protein 23  46.09 
 
 
166 aa  101  6e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.369118  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2252  alkaline shock protein 23  40 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.795316  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2213  alkaline shock protein 23  40 
 
 
169 aa  95.5  3e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0790  hypothetical protein  35.96 
 
 
127 aa  86.7  2e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.668683  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2794  protein of unknown function DUF322  36.64 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.119411  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0290  protein of unknown function DUF322  38.89 
 
 
158 aa  80.1  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.502178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8027  hypothetical protein  37.19 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.206185  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2233  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.340857  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2272  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.501801  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2280  hypothetical protein  36.09 
 
 
152 aa  79  0.00000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.347152  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3379  hypothetical protein  33.62 
 
 
149 aa  76.3  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0676436  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0774  hypothetical protein  38.02 
 
 
182 aa  75.9  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.28582  normal  0.234272 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0837  hypothetical protein  31.71 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000105699  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3258  protein of unknown function DUF322  35.29 
 
 
178 aa  75.5  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1523  hypothetical protein  35.04 
 
 
137 aa  74.7  0.0000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000646424  normal  0.0376642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4065  protein of unknown function DUF322  37.8 
 
 
155 aa  73.9  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2628  protein of unknown function DUF322  33.8 
 
 
145 aa  72.4  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000769408  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3957  hypothetical protein  30.43 
 
 
161 aa  72  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.951058  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3506  protein of unknown function DUF322  34.19 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000443338  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4774  protein of unknown function DUF322  34.38 
 
 
167 aa  70.9  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.18923  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0989  protein of unknown function DUF322  34.62 
 
 
139 aa  69.3  0.00000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.199857  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1533  hypothetical protein  27.82 
 
 
135 aa  67.8  0.00000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.732766  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3467  protein of unknown function DUF322  32.5 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.865658 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1108  protein of unknown function DUF322  35.29 
 
 
130 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000124117  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1595  protein of unknown function DUF322  30.99 
 
 
168 aa  65.5  0.0000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.521971  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1908  protein of unknown function DUF322  31.03 
 
 
127 aa  65.1  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3351  protein of unknown function DUF322  35.16 
 
 
166 aa  65.1  0.0000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.40456  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4681  protein of unknown function DUF322  39.02 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.593133  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0561  hypothetical protein  28.35 
 
 
134 aa  64.3  0.0000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000106209  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0413  protein of unknown function DUF322  33.04 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4348  hypothetical protein  33.06 
 
 
162 aa  62.8  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0313929  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1282  protein of unknown function DUF322  32.76 
 
 
133 aa  63.2  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000067785  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1464  protein of unknown function DUF322  38.78 
 
 
150 aa  62.4  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4994  protein of unknown function DUF322  36.27 
 
 
120 aa  61.6  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0273  protein of unknown function DUF322  33.94 
 
 
170 aa  60.1  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2964  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  58.5  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.722769  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06270  hypothetical protein  30.39 
 
 
132 aa  58.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000136905  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1066  hypothetical protein  35.29 
 
 
137 aa  58.5  0.00000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000039435  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0617  protein of unknown function DUF322  27.2 
 
 
153 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.208416 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27170  hypothetical protein  30.53 
 
 
164 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.730577  normal  0.440149 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0998  protein of unknown function DUF322  35.29 
 
 
128 aa  55.5  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2876  hypothetical protein  32.76 
 
 
130 aa  55.1  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0976697  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1017  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000000325612  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2326  protein of unknown function DUF322  28.45 
 
 
131 aa  54.3  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000599295  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1186  hypothetical protein  30.25 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00330637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0407  hypothetical protein  29.09 
 
 
153 aa  53.5  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4470  protein of unknown function DUF322  34.23 
 
 
160 aa  53.5  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0173793  normal  0.120743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2601  protein of unknown function DUF322  29.41 
 
 
119 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00304774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0245  protein of unknown function DUF322  28.3 
 
 
133 aa  52.4  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2516  hypothetical protein  27.03 
 
 
130 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.55961  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1761  protein of unknown function DUF322  29.81 
 
 
126 aa  51.2  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.223537 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0389  protein of unknown function DUF322  30 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1714  hypothetical protein  33.33 
 
 
129 aa  48.9  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.353147  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0721  hypothetical protein  29.69 
 
 
133 aa  49.3  0.00003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.210577  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2659  protein of unknown function DUF322  29.47 
 
 
237 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000270753  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1783  protein of unknown function DUF322  26.73 
 
 
148 aa  46.6  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4035  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1617  hypothetical protein  33.04 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.109012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4256  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4087  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.18348  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3925  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3936  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.294026  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4407  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4313  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4293  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0941  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00995769 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4203  hypothetical protein  33.62 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000323253 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1138  protein of unknown function DUF322  30.26 
 
 
142 aa  45.4  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000000668852  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1694  hypothetical protein  28.68 
 
 
129 aa  44.7  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1598  protein of unknown function DUF322  43.64 
 
 
161 aa  44.3  0.0008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1705  protein of unknown function DUF322  25.83 
 
 
124 aa  44.3  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.989447  normal  0.278624 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10090  hypothetical protein  23.21 
 
 
120 aa  43.1  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.10411e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2097  protein of unknown function DUF322  30 
 
 
201 aa  42.4  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000127517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1186  hypothetical protein  30.59 
 
 
277 aa  42.4  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1344  protein of unknown function DUF322  22.94 
 
 
119 aa  42  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.635847  normal  0.332386 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1750  protein of unknown function DUF322  26.92 
 
 
138 aa  42  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2439  protein of unknown function DUF322  32.65 
 
 
111 aa  41.6  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1793  alkaline shock protein  25.69 
 
 
129 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0585534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2079  alkaline shock protein  25.69 
 
 
129 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102163  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1089  hypothetical protein  25.93 
 
 
114 aa  41.2  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>