More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2988 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2988  protein of unknown function DUF140  100 
 
 		 285 aa  561  1.0000000000000001e-159  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0012  hypothetical protein  55.94 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.261504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0957  hypothetical protein  55.56 
 
 		 281 aa  300  1e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6634  protein of unknown function DUF140  53.28 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.451559  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2250  protein of unknown function DUF140  51.02 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03700  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  51.52 
 
 		 250 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.270229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1128  protein of unknown function DUF140  52.03 
 
 		 268 aa  230  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0856  hypothetical protein  46.22 
 
 		 253 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.792912 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4348  protein of unknown function DUF140  46.34 
 
 		 285 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0701  hypothetical protein  50 
 
 		 261 aa  216  2.9999999999999998e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1246  protein of unknown function DUF140  50 
 
 		 285 aa  212  4.9999999999999996e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.869523  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1554  hypothetical protein  48 
 
 		 237 aa  211  7.999999999999999e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09380  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents, permease component  48.22 
 
 		 267 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5204  hypothetical protein  47.98 
 
 		 237 aa  210  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.217332 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4619  hypothetical protein  46.61 
 
 		 254 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4707  hypothetical protein  46.61 
 
 		 254 aa  208  9e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5002  hypothetical protein  46.19 
 
 		 254 aa  207  2e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13535  integral membrane protein YrbE4a  47.06 
 
 		 254 aa  205  8e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000148357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3830  protein of unknown function DUF140  45.61 
 
 		 267 aa  204  2e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4170  protein of unknown function DUF140  42.86 
 
 		 285 aa  195  9e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4606  hypothetical protein  43.64 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.809194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4172  hypothetical protein  42.37 
 
 		 257 aa  192  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1221  protein of unknown function DUF140  50.25 
 
 		 349 aa  189  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2826  hypothetical protein  45 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1625  hypothetical protein  44.2 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1650  hypothetical protein  44.2 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1676  hypothetical protein  44.2 
 
 		 266 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.277826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0498  hypothetical protein  44.2 
 
 		 269 aa  186  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0382697  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3789  protein of unknown function DUF140  41.9 
 
 		 272 aa  186  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4540  hypothetical protein  43.05 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.113009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2849  hypothetical protein  43.5 
 
 		 270 aa  185  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10598  integral membrane protein YrbE2a  39.92 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2099  hypothetical protein  42.37 
 
 		 255 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.26077  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0654  hypothetical protein  43.75 
 
 		 269 aa  184  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0633475  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1522  hypothetical protein  42.31 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.926137  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1545  hypothetical protein  42.31 
 
 		 271 aa  183  3e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10168  integral membrane protein YrbE1a  41.34 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2506  hypothetical protein  43.05 
 
 		 269 aa  183  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.423121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3673  hypothetical protein  42.34 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3746  hypothetical protein  42.34 
 
 		 270 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0264  hypothetical protein  43.24 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.720653 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0273  hypothetical protein  43.24 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3686  hypothetical protein  42.53 
 
 		 270 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.86718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0283  hypothetical protein  43.24 
 
 		 256 aa  182  8.000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.23346 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0520  protein of unknown function DUF140  43.04 
 
 		 262 aa  181  1e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3025  ABC-type transport system involved in resistance to organic solvents permease component-like protein  41.95 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.753078  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4401  hypothetical protein  43.06 
 
 		 250 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3952  protein of unknown function DUF140  43.46 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4152  hypothetical protein  43.95 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4190  hypothetical protein  41.53 
 
 		 255 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.731627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0833  hypothetical protein  44.8 
 
 		 297 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3984  hypothetical protein  38.98 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0713  hypothetical protein  40.08 
 
 		 265 aa  172  5e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0132  hypothetical protein  39.29 
 
 		 265 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.99032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0106  hypothetical protein  39.46 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.963801 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0116  hypothetical protein  39.46 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.239683  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0125  hypothetical protein  39.46 
 
 		 265 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.288689  normal  0.150892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0361  hypothetical protein  38.12 
 
 		 256 aa  163  4.0000000000000004e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0920  hypothetical protein  44.91 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.403471 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1620  protein of unknown function DUF140  38.01 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.346599  normal  0.915848 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  34.23 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2096  hypothetical protein  34.23 
 
 		 249 aa  126  4.0000000000000003e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.738909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0575  hypothetical protein  34.65 
 
 		 249 aa  120  3.9999999999999996e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  30.27 
 
 		 264 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2378  protein of unknown function DUF140  32.89 
 
 		 255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  32.94 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1422  putative transporter, membrane component  31.42 
 
 		 251 aa  116  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  32.31 
 
 		 267 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0708  protein of unknown function DUF140  36.73 
 
 		 272 aa  115  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.356543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  31.74 
 
 		 251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  30.13 
 
 		 256 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  33.48 
 
 		 261 aa  113  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  29.6 
 
 		 258 aa  113  3e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15101  putative transporter, membrane component  30.97 
 
 		 251 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5283  protein of unknown function DUF140  31.2 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.125379 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17511  putative transporter, membrane component  31.78 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  28.78 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0895  putative transporter, membrane component  32.41 
 
 		 249 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.378431  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  31.28 
 
 		 267 aa  112  9e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15241  putative transporter, membrane component  30.53 
 
 		 251 aa  112  9e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0680677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  30.96 
 
 		 251 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  30.87 
 
 		 251 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  31.67 
 
 		 257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  31.78 
 
 		 250 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  31.58 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  31.14 
 
 		 263 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  31.13 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14851  putative transporter, membrane component  30.97 
 
 		 251 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  31.39 
 
 		 267 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  28.97 
 
 		 261 aa  109  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  32.89 
 
 		 249 aa  108  8.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1871  protein of unknown function DUF140  29.33 
 
 		 264 aa  108  8.000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0106887 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  32.74 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  31.82 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  32.16 
 
 		 264 aa  107  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13781  putative transporter, membrane component  32.24 
 
 		 248 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.539878  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  31.12 
 
 		 257 aa  106  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1812  protein of unknown function DUF140  32.89 
 
 		 271 aa  106  5e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.402733 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11995  integral membrane protein YrbE3a  39.69 
 
 		 141 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  29.66 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>